Protein–RNA interactions for Protein: Q16563

SYPL1, Synaptophysin-like protein 1, humanhuman

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Length 259 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYPL1Q16563 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SYPL1Q16563 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SYPL1Q16563 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
SYPL1Q16563 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SYPL1Q16563 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SYPL1Q16563 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SYPL1Q16563 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SYPL1Q16563 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SYPL1Q16563 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SYPL1Q16563 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SYPL1Q16563 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SYPL1Q16563 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SYPL1Q16563 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SYPL1Q16563 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SYPL1Q16563 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SYPL1Q16563 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SYPL1Q16563 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
SYPL1Q16563 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SYPL1Q16563 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SYPL1Q16563 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SYPL1Q16563 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SYPL1Q16563 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SYPL1Q16563 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SYPL1Q16563 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SYPL1Q16563 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SYPL1Q16563 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SYPL1Q16563 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SYPL1Q16563 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SYPL1Q16563 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SYPL1Q16563 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SYPL1Q16563 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SYPL1Q16563 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SYPL1Q16563 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SYPL1Q16563 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SYPL1Q16563 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SYPL1Q16563 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SYPL1Q16563 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SYPL1Q16563 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SYPL1Q16563 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SYPL1Q16563 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SYPL1Q16563 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SYPL1Q16563 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SYPL1Q16563 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SYPL1Q16563 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
SYPL1Q16563 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SYPL1Q16563 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SYPL1Q16563 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SYPL1Q16563 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SYPL1Q16563 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SYPL1Q16563 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SYPL1Q16563 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SYPL1Q16563 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
SYPL1Q16563 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SYPL1Q16563 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
SYPL1Q16563 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
SYPL1Q16563 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SYPL1Q16563 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
SYPL1Q16563 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SYPL1Q16563 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SYPL1Q16563 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SYPL1Q16563 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SYPL1Q16563 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SYPL1Q16563 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SYPL1Q16563 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SYPL1Q16563 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SYPL1Q16563 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
SYPL1Q16563 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
SYPL1Q16563 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SYPL1Q16563 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SYPL1Q16563 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SYPL1Q16563 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SYPL1Q16563 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SYPL1Q16563 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SYPL1Q16563 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SYPL1Q16563 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SYPL1Q16563 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SYPL1Q16563 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SYPL1Q16563 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SYPL1Q16563 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SYPL1Q16563 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
SYPL1Q16563 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SYPL1Q16563 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SYPL1Q16563 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
SYPL1Q16563 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SYPL1Q16563 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SYPL1Q16563 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SYPL1Q16563 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
SYPL1Q16563 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SYPL1Q16563 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SYPL1Q16563 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SYPL1Q16563 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SYPL1Q16563 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SYPL1Q16563 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SYPL1Q16563 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SYPL1Q16563 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SYPL1Q16563 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SYPL1Q16563 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SYPL1Q16563 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SYPL1Q16563 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SYPL1Q16563 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
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