Protein–RNA interactions for Protein: Q16533

SNAPC1, snRNA-activating protein complex subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 368 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNAPC1Q16533 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
SNAPC1Q16533 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
SNAPC1Q16533 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
SNAPC1Q16533 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
SNAPC1Q16533 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
SNAPC1Q16533 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
SNAPC1Q16533 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
SNAPC1Q16533 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
SNAPC1Q16533 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
SNAPC1Q16533 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
SNAPC1Q16533 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
SNAPC1Q16533 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
SNAPC1Q16533 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
SNAPC1Q16533 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
SNAPC1Q16533 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
SNAPC1Q16533 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
SNAPC1Q16533 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
SNAPC1Q16533 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC19.62■□□□□ 0.73
SNAPC1Q16533 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
SNAPC1Q16533 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
SNAPC1Q16533 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
SNAPC1Q16533 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
SNAPC1Q16533 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
SNAPC1Q16533 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
SNAPC1Q16533 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
SNAPC1Q16533 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
SNAPC1Q16533 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
SNAPC1Q16533 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
SNAPC1Q16533 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
SNAPC1Q16533 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
SNAPC1Q16533 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
SNAPC1Q16533 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
SNAPC1Q16533 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
SNAPC1Q16533 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
SNAPC1Q16533 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
SNAPC1Q16533 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
SNAPC1Q16533 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
SNAPC1Q16533 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
SNAPC1Q16533 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
SNAPC1Q16533 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
SNAPC1Q16533 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
SNAPC1Q16533 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SNAPC1Q16533 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SNAPC1Q16533 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SNAPC1Q16533 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SNAPC1Q16533 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SNAPC1Q16533 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SNAPC1Q16533 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SNAPC1Q16533 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SNAPC1Q16533 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SNAPC1Q16533 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SNAPC1Q16533 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SNAPC1Q16533 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SNAPC1Q16533 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SNAPC1Q16533 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SNAPC1Q16533 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SNAPC1Q16533 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SNAPC1Q16533 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SNAPC1Q16533 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SNAPC1Q16533 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SNAPC1Q16533 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SNAPC1Q16533 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SNAPC1Q16533 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SNAPC1Q16533 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SNAPC1Q16533 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SNAPC1Q16533 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
SNAPC1Q16533 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
SNAPC1Q16533 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC19.58■□□□□ 0.73
SNAPC1Q16533 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
SNAPC1Q16533 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
SNAPC1Q16533 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
SNAPC1Q16533 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
SNAPC1Q16533 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC19.58■□□□□ 0.72
SNAPC1Q16533 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC19.58■□□□□ 0.72
SNAPC1Q16533 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
SNAPC1Q16533 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
SNAPC1Q16533 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
SNAPC1Q16533 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
SNAPC1Q16533 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC19.58■□□□□ 0.72
SNAPC1Q16533 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SNAPC1Q16533 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SNAPC1Q16533 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SNAPC1Q16533 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SNAPC1Q16533 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SNAPC1Q16533 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SNAPC1Q16533 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SNAPC1Q16533 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SNAPC1Q16533 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SNAPC1Q16533 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SNAPC1Q16533 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SNAPC1Q16533 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SNAPC1Q16533 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SNAPC1Q16533 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SNAPC1Q16533 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SNAPC1Q16533 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SNAPC1Q16533 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SNAPC1Q16533 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SNAPC1Q16533 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SNAPC1Q16533 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SNAPC1Q16533 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.7 ms