Protein–RNA interactions for Protein: Q16518

RPE65, Retinoid isomerohydrolase, humanhuman

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Length 533 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPE65Q16518 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
RPE65Q16518 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
RPE65Q16518 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
RPE65Q16518 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.95
RPE65Q16518 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
RPE65Q16518 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
RPE65Q16518 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
RPE65Q16518 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
RPE65Q16518 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
RPE65Q16518 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
RPE65Q16518 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
RPE65Q16518 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
RPE65Q16518 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
RPE65Q16518 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
RPE65Q16518 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
RPE65Q16518 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
RPE65Q16518 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
RPE65Q16518 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
RPE65Q16518 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
RPE65Q16518 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
RPE65Q16518 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
RPE65Q16518 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
RPE65Q16518 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
RPE65Q16518 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC21■□□□□ 0.95
RPE65Q16518 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
RPE65Q16518 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
RPE65Q16518 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
RPE65Q16518 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC21■□□□□ 0.95
RPE65Q16518 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
RPE65Q16518 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
RPE65Q16518 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
RPE65Q16518 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
RPE65Q16518 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
RPE65Q16518 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
RPE65Q16518 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
RPE65Q16518 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
RPE65Q16518 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC20.99■□□□□ 0.95
RPE65Q16518 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
RPE65Q16518 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC20.99■□□□□ 0.95
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RPE65Q16518 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
RPE65Q16518 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
RPE65Q16518 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
RPE65Q16518 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
RPE65Q16518 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
RPE65Q16518 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
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RPE65Q16518 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
RPE65Q16518 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
RPE65Q16518 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
RPE65Q16518 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
RPE65Q16518 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
RPE65Q16518 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
RPE65Q16518 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
RPE65Q16518 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
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RPE65Q16518 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
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RPE65Q16518 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
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RPE65Q16518 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC20.98■□□□□ 0.95
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RPE65Q16518 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
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RPE65Q16518 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
RPE65Q16518 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
RPE65Q16518 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
RPE65Q16518 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
RPE65Q16518 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
RPE65Q16518 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
RPE65Q16518 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
RPE65Q16518 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
RPE65Q16518 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
RPE65Q16518 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
RPE65Q16518 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
RPE65Q16518 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
RPE65Q16518 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
RPE65Q16518 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
RPE65Q16518 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
RPE65Q16518 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
RPE65Q16518 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
RPE65Q16518 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
RPE65Q16518 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
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