Protein–RNA interactions for Protein: Q15788

NCOA1, Nuclear receptor coactivator 1, humanhuman

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Length 1,441 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCOA1Q15788 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
NCOA1Q15788 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.54■■■□□ 2.8
NCOA1Q15788 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC32.54■■■□□ 2.8
NCOA1Q15788 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC32.54■■■□□ 2.8
NCOA1Q15788 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
NCOA1Q15788 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC32.53■■■□□ 2.8
NCOA1Q15788 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
NCOA1Q15788 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC32.53■■■□□ 2.8
NCOA1Q15788 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
NCOA1Q15788 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC32.53■■■□□ 2.8
NCOA1Q15788 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
NCOA1Q15788 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
NCOA1Q15788 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
NCOA1Q15788 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
NCOA1Q15788 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
NCOA1Q15788 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
NCOA1Q15788 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC32.52■■■□□ 2.8
NCOA1Q15788 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
NCOA1Q15788 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
NCOA1Q15788 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
NCOA1Q15788 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
NCOA1Q15788 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
NCOA1Q15788 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
NCOA1Q15788 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC32.52■■■□□ 2.8
NCOA1Q15788 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC32.52■■■□□ 2.8
NCOA1Q15788 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.8
NCOA1Q15788 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.8
NCOA1Q15788 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC32.51■■■□□ 2.8
NCOA1Q15788 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC32.51■■■□□ 2.8
NCOA1Q15788 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC32.51■■■□□ 2.8
NCOA1Q15788 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC32.51■■■□□ 2.8
NCOA1Q15788 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC32.51■■■□□ 2.8
NCOA1Q15788 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.8
NCOA1Q15788 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.8
NCOA1Q15788 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.8
NCOA1Q15788 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.51■■■□□ 2.8
NCOA1Q15788 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.8
NCOA1Q15788 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.8
NCOA1Q15788 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.79
NCOA1Q15788 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.79
NCOA1Q15788 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.79
NCOA1Q15788 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC32.51■■■□□ 2.79
NCOA1Q15788 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC32.51■■■□□ 2.79
NCOA1Q15788 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC32.5■■■□□ 2.79
NCOA1Q15788 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.5■■■□□ 2.79
NCOA1Q15788 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
NCOA1Q15788 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
NCOA1Q15788 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
NCOA1Q15788 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
NCOA1Q15788 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.5■■■□□ 2.79
NCOA1Q15788 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
NCOA1Q15788 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
NCOA1Q15788 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC32.5■■■□□ 2.79
NCOA1Q15788 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.5■■■□□ 2.79
NCOA1Q15788 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC32.5■■■□□ 2.79
NCOA1Q15788 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC32.5■■■□□ 2.79
NCOA1Q15788 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.49■■■□□ 2.79
NCOA1Q15788 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.49■■■□□ 2.79
NCOA1Q15788 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
NCOA1Q15788 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC32.49■■■□□ 2.79
NCOA1Q15788 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC32.49■■■□□ 2.79
NCOA1Q15788 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC32.49■■■□□ 2.79
NCOA1Q15788 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
NCOA1Q15788 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC32.49■■■□□ 2.79
NCOA1Q15788 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC32.48■■■□□ 2.79
NCOA1Q15788 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC32.48■■■□□ 2.79
NCOA1Q15788 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC32.48■■■□□ 2.79
NCOA1Q15788 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
NCOA1Q15788 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
NCOA1Q15788 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
NCOA1Q15788 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC32.47■■■□□ 2.79
NCOA1Q15788 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC32.47■■■□□ 2.79
NCOA1Q15788 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC32.47■■■□□ 2.79
NCOA1Q15788 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
NCOA1Q15788 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
NCOA1Q15788 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC32.47■■■□□ 2.79
NCOA1Q15788 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.46■■■□□ 2.79
NCOA1Q15788 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.46■■■□□ 2.79
NCOA1Q15788 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
NCOA1Q15788 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC32.46■■■□□ 2.79
NCOA1Q15788 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC32.46■■■□□ 2.79
NCOA1Q15788 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC32.46■■■□□ 2.79
NCOA1Q15788 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC32.46■■■□□ 2.79
NCOA1Q15788 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC32.46■■■□□ 2.79
NCOA1Q15788 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC32.46■■■□□ 2.79
NCOA1Q15788 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
NCOA1Q15788 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
NCOA1Q15788 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC32.46■■■□□ 2.79
NCOA1Q15788 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
NCOA1Q15788 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.45■■■□□ 2.79
NCOA1Q15788 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.79
NCOA1Q15788 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC32.45■■■□□ 2.79
NCOA1Q15788 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC32.45■■■□□ 2.79
NCOA1Q15788 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.79
NCOA1Q15788 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.45■■■□□ 2.79
NCOA1Q15788 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.79
NCOA1Q15788 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.79
NCOA1Q15788 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC32.45■■■□□ 2.79
NCOA1Q15788 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
NCOA1Q15788 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC32.44■■■□□ 2.78
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