Protein–RNA interactions for Protein: Q15751

HERC1, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC1, humanhuman

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Length 4,861 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC1Q15751 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
HERC1Q15751 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
HERC1Q15751 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
HERC1Q15751 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
HERC1Q15751 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
HERC1Q15751 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
HERC1Q15751 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
HERC1Q15751 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
HERC1Q15751 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
HERC1Q15751 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
HERC1Q15751 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
HERC1Q15751 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
HERC1Q15751 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC12.79□□□□□ -0.36
HERC1Q15751 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
HERC1Q15751 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC12.79□□□□□ -0.36
HERC1Q15751 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC12.79□□□□□ -0.36
HERC1Q15751 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.79□□□□□ -0.36
HERC1Q15751 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
HERC1Q15751 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
HERC1Q15751 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
HERC1Q15751 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
HERC1Q15751 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
HERC1Q15751 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
HERC1Q15751 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC12.78□□□□□ -0.36
HERC1Q15751 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
HERC1Q15751 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
HERC1Q15751 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
HERC1Q15751 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
HERC1Q15751 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
HERC1Q15751 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
HERC1Q15751 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
HERC1Q15751 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
HERC1Q15751 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
HERC1Q15751 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
HERC1Q15751 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
HERC1Q15751 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
HERC1Q15751 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
HERC1Q15751 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
HERC1Q15751 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
HERC1Q15751 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
HERC1Q15751 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
HERC1Q15751 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
HERC1Q15751 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
HERC1Q15751 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
HERC1Q15751 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
HERC1Q15751 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
HERC1Q15751 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC12.77□□□□□ -0.37
HERC1Q15751 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
HERC1Q15751 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
HERC1Q15751 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
HERC1Q15751 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
HERC1Q15751 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
HERC1Q15751 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
HERC1Q15751 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
HERC1Q15751 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC12.77□□□□□ -0.37
HERC1Q15751 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
HERC1Q15751 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
HERC1Q15751 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
HERC1Q15751 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
HERC1Q15751 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
HERC1Q15751 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC12.77□□□□□ -0.37
HERC1Q15751 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
HERC1Q15751 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
HERC1Q15751 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
HERC1Q15751 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
HERC1Q15751 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
HERC1Q15751 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
HERC1Q15751 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
HERC1Q15751 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
HERC1Q15751 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
HERC1Q15751 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
HERC1Q15751 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
HERC1Q15751 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
HERC1Q15751 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
HERC1Q15751 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
HERC1Q15751 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
HERC1Q15751 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
HERC1Q15751 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
HERC1Q15751 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
HERC1Q15751 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
HERC1Q15751 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
HERC1Q15751 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
HERC1Q15751 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
HERC1Q15751 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
HERC1Q15751 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
HERC1Q15751 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
HERC1Q15751 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
HERC1Q15751 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
HERC1Q15751 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
HERC1Q15751 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
HERC1Q15751 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
HERC1Q15751 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
HERC1Q15751 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
HERC1Q15751 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
HERC1Q15751 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
HERC1Q15751 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
HERC1Q15751 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
HERC1Q15751 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
HERC1Q15751 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
HERC1Q15751 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
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