Protein–RNA interactions for Protein: Q15475

SIX1, Homeobox protein SIX1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 284 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIX1Q15475 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SIX1Q15475 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SIX1Q15475 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
SIX1Q15475 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SIX1Q15475 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SIX1Q15475 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SIX1Q15475 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SIX1Q15475 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SIX1Q15475 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SIX1Q15475 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SIX1Q15475 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SIX1Q15475 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SIX1Q15475 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SIX1Q15475 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SIX1Q15475 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SIX1Q15475 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SIX1Q15475 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SIX1Q15475 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SIX1Q15475 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SIX1Q15475 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SIX1Q15475 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SIX1Q15475 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SIX1Q15475 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SIX1Q15475 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SIX1Q15475 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SIX1Q15475 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SIX1Q15475 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SIX1Q15475 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SIX1Q15475 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SIX1Q15475 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SIX1Q15475 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SIX1Q15475 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SIX1Q15475 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SIX1Q15475 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SIX1Q15475 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SIX1Q15475 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SIX1Q15475 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SIX1Q15475 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SIX1Q15475 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SIX1Q15475 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SIX1Q15475 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
SIX1Q15475 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SIX1Q15475 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SIX1Q15475 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SIX1Q15475 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SIX1Q15475 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SIX1Q15475 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
SIX1Q15475 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SIX1Q15475 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SIX1Q15475 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SIX1Q15475 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
SIX1Q15475 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SIX1Q15475 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SIX1Q15475 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SIX1Q15475 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SIX1Q15475 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SIX1Q15475 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SIX1Q15475 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SIX1Q15475 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SIX1Q15475 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SIX1Q15475 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SIX1Q15475 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SIX1Q15475 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SIX1Q15475 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SIX1Q15475 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SIX1Q15475 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SIX1Q15475 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SIX1Q15475 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SIX1Q15475 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SIX1Q15475 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SIX1Q15475 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SIX1Q15475 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
SIX1Q15475 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SIX1Q15475 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SIX1Q15475 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SIX1Q15475 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SIX1Q15475 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SIX1Q15475 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SIX1Q15475 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SIX1Q15475 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SIX1Q15475 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SIX1Q15475 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
SIX1Q15475 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SIX1Q15475 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SIX1Q15475 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SIX1Q15475 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SIX1Q15475 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SIX1Q15475 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SIX1Q15475 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SIX1Q15475 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SIX1Q15475 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SIX1Q15475 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SIX1Q15475 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SIX1Q15475 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SIX1Q15475 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
SIX1Q15475 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SIX1Q15475 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SIX1Q15475 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SIX1Q15475 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SIX1Q15475 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
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