Protein–RNA interactions for Protein: Q15428

SF3A2, Splicing factor 3A subunit 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 464 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SF3A2Q15428 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SF3A2Q15428 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SF3A2Q15428 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SF3A2Q15428 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
SF3A2Q15428 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SF3A2Q15428 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SF3A2Q15428 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SF3A2Q15428 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SF3A2Q15428 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SF3A2Q15428 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SF3A2Q15428 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SF3A2Q15428 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SF3A2Q15428 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SF3A2Q15428 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SF3A2Q15428 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
SF3A2Q15428 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SF3A2Q15428 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SF3A2Q15428 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SF3A2Q15428 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SF3A2Q15428 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SF3A2Q15428 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SF3A2Q15428 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SF3A2Q15428 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SF3A2Q15428 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SF3A2Q15428 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SF3A2Q15428 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SF3A2Q15428 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SF3A2Q15428 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SF3A2Q15428 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SF3A2Q15428 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SF3A2Q15428 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SF3A2Q15428 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SF3A2Q15428 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SF3A2Q15428 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SF3A2Q15428 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SF3A2Q15428 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SF3A2Q15428 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SF3A2Q15428 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SF3A2Q15428 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SF3A2Q15428 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
SF3A2Q15428 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
SF3A2Q15428 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SF3A2Q15428 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SF3A2Q15428 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SF3A2Q15428 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
SF3A2Q15428 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
SF3A2Q15428 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SF3A2Q15428 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SF3A2Q15428 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SF3A2Q15428 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SF3A2Q15428 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SF3A2Q15428 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SF3A2Q15428 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SF3A2Q15428 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SF3A2Q15428 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SF3A2Q15428 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SF3A2Q15428 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SF3A2Q15428 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
SF3A2Q15428 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SF3A2Q15428 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SF3A2Q15428 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SF3A2Q15428 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SF3A2Q15428 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SF3A2Q15428 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SF3A2Q15428 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.02
SF3A2Q15428 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
SF3A2Q15428 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SF3A2Q15428 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SF3A2Q15428 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SF3A2Q15428 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SF3A2Q15428 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
SF3A2Q15428 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SF3A2Q15428 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SF3A2Q15428 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SF3A2Q15428 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SF3A2Q15428 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SF3A2Q15428 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SF3A2Q15428 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
SF3A2Q15428 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SF3A2Q15428 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SF3A2Q15428 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SF3A2Q15428 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SF3A2Q15428 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SF3A2Q15428 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SF3A2Q15428 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SF3A2Q15428 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SF3A2Q15428 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SF3A2Q15428 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SF3A2Q15428 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SF3A2Q15428 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SF3A2Q15428 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
SF3A2Q15428 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SF3A2Q15428 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SF3A2Q15428 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SF3A2Q15428 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
SF3A2Q15428 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SF3A2Q15428 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SF3A2Q15428 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SF3A2Q15428 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
SF3A2Q15428 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
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