Protein–RNA interactions for Protein: Q15397

PUM3, Pumilio homolog 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 648 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PUM3Q15397 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
PUM3Q15397 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
PUM3Q15397 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
PUM3Q15397 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
PUM3Q15397 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
PUM3Q15397 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
PUM3Q15397 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
PUM3Q15397 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
PUM3Q15397 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.82
PUM3Q15397 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
PUM3Q15397 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
PUM3Q15397 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
PUM3Q15397 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
PUM3Q15397 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
PUM3Q15397 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
PUM3Q15397 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
PUM3Q15397 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
PUM3Q15397 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
PUM3Q15397 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
PUM3Q15397 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC26.44■■□□□ 1.82
PUM3Q15397 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
PUM3Q15397 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
PUM3Q15397 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
PUM3Q15397 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
PUM3Q15397 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
PUM3Q15397 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
PUM3Q15397 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
PUM3Q15397 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
PUM3Q15397 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
PUM3Q15397 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
PUM3Q15397 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
PUM3Q15397 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC26.43■■□□□ 1.82
PUM3Q15397 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
PUM3Q15397 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
PUM3Q15397 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
PUM3Q15397 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
PUM3Q15397 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
PUM3Q15397 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
PUM3Q15397 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
PUM3Q15397 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
PUM3Q15397 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
PUM3Q15397 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC26.42■■□□□ 1.82
PUM3Q15397 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
PUM3Q15397 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
PUM3Q15397 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
PUM3Q15397 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
PUM3Q15397 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
PUM3Q15397 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
PUM3Q15397 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
PUM3Q15397 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
PUM3Q15397 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
PUM3Q15397 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
PUM3Q15397 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC26.41■■□□□ 1.82
PUM3Q15397 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
PUM3Q15397 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
PUM3Q15397 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC26.41■■□□□ 1.82
PUM3Q15397 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
PUM3Q15397 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
PUM3Q15397 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
PUM3Q15397 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
PUM3Q15397 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
PUM3Q15397 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
PUM3Q15397 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
PUM3Q15397 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
PUM3Q15397 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
PUM3Q15397 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
PUM3Q15397 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
PUM3Q15397 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
PUM3Q15397 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
PUM3Q15397 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC26.4■■□□□ 1.82
PUM3Q15397 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
PUM3Q15397 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
PUM3Q15397 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
PUM3Q15397 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
PUM3Q15397 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC26.4■■□□□ 1.82
PUM3Q15397 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
PUM3Q15397 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
PUM3Q15397 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
PUM3Q15397 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
PUM3Q15397 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
PUM3Q15397 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
PUM3Q15397 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
PUM3Q15397 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
PUM3Q15397 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
PUM3Q15397 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
PUM3Q15397 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
PUM3Q15397 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
PUM3Q15397 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
PUM3Q15397 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.81
PUM3Q15397 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.81
PUM3Q15397 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.81
PUM3Q15397 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.81
PUM3Q15397 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
PUM3Q15397 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
PUM3Q15397 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
PUM3Q15397 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
PUM3Q15397 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
PUM3Q15397 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
PUM3Q15397 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
PUM3Q15397 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
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