Protein–RNA interactions for Protein: Q15032

R3HDM1, R3H domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,099 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
R3HDM1Q15032 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
R3HDM1Q15032 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
R3HDM1Q15032 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
R3HDM1Q15032 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC27.76■■■□□ 2.04
R3HDM1Q15032 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
R3HDM1Q15032 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
R3HDM1Q15032 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
R3HDM1Q15032 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
R3HDM1Q15032 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
R3HDM1Q15032 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC27.76■■■□□ 2.03
R3HDM1Q15032 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
R3HDM1Q15032 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC27.76■■■□□ 2.03
R3HDM1Q15032 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
R3HDM1Q15032 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC27.76■■■□□ 2.03
R3HDM1Q15032 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
R3HDM1Q15032 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
R3HDM1Q15032 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC27.76■■■□□ 2.03
R3HDM1Q15032 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
R3HDM1Q15032 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
R3HDM1Q15032 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
R3HDM1Q15032 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
R3HDM1Q15032 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
R3HDM1Q15032 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
R3HDM1Q15032 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
R3HDM1Q15032 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
R3HDM1Q15032 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
R3HDM1Q15032 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
R3HDM1Q15032 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
R3HDM1Q15032 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
R3HDM1Q15032 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
R3HDM1Q15032 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
R3HDM1Q15032 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
R3HDM1Q15032 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
R3HDM1Q15032 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
R3HDM1Q15032 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
R3HDM1Q15032 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
R3HDM1Q15032 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
R3HDM1Q15032 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
R3HDM1Q15032 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
R3HDM1Q15032 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
R3HDM1Q15032 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
R3HDM1Q15032 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
R3HDM1Q15032 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
R3HDM1Q15032 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
R3HDM1Q15032 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
R3HDM1Q15032 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
R3HDM1Q15032 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
R3HDM1Q15032 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
R3HDM1Q15032 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
R3HDM1Q15032 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
R3HDM1Q15032 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
R3HDM1Q15032 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
R3HDM1Q15032 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
R3HDM1Q15032 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
R3HDM1Q15032 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
R3HDM1Q15032 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC27.72■■■□□ 2.03
R3HDM1Q15032 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
R3HDM1Q15032 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
R3HDM1Q15032 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
R3HDM1Q15032 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
R3HDM1Q15032 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
R3HDM1Q15032 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
R3HDM1Q15032 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
R3HDM1Q15032 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
R3HDM1Q15032 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
R3HDM1Q15032 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
R3HDM1Q15032 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
R3HDM1Q15032 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
R3HDM1Q15032 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
R3HDM1Q15032 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
R3HDM1Q15032 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
R3HDM1Q15032 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.03
R3HDM1Q15032 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.03
R3HDM1Q15032 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
R3HDM1Q15032 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
R3HDM1Q15032 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
R3HDM1Q15032 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
R3HDM1Q15032 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.02
R3HDM1Q15032 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
R3HDM1Q15032 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
R3HDM1Q15032 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.02
R3HDM1Q15032 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
R3HDM1Q15032 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
R3HDM1Q15032 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.02
R3HDM1Q15032 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
R3HDM1Q15032 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
R3HDM1Q15032 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
R3HDM1Q15032 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
R3HDM1Q15032 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
R3HDM1Q15032 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
R3HDM1Q15032 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
R3HDM1Q15032 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
R3HDM1Q15032 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
R3HDM1Q15032 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC27.69■■■□□ 2.02
R3HDM1Q15032 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
R3HDM1Q15032 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC27.69■■■□□ 2.02
R3HDM1Q15032 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
R3HDM1Q15032 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC27.69■■■□□ 2.02
R3HDM1Q15032 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC27.69■■■□□ 2.02
R3HDM1Q15032 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
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