Protein–RNA interactions for Protein: Q14684

RRP1B, Ribosomal RNA processing protein 1 homolog B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 758 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRP1BQ14684 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
RRP1BQ14684 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
RRP1BQ14684 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
RRP1BQ14684 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
RRP1BQ14684 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
RRP1BQ14684 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
RRP1BQ14684 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
RRP1BQ14684 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
RRP1BQ14684 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
RRP1BQ14684 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
RRP1BQ14684 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
RRP1BQ14684 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
RRP1BQ14684 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
RRP1BQ14684 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
RRP1BQ14684 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
RRP1BQ14684 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
RRP1BQ14684 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
RRP1BQ14684 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
RRP1BQ14684 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
RRP1BQ14684 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
RRP1BQ14684 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
RRP1BQ14684 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
RRP1BQ14684 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
RRP1BQ14684 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
RRP1BQ14684 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
RRP1BQ14684 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
RRP1BQ14684 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
RRP1BQ14684 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
RRP1BQ14684 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
RRP1BQ14684 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
RRP1BQ14684 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
RRP1BQ14684 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
RRP1BQ14684 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
RRP1BQ14684 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
RRP1BQ14684 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
RRP1BQ14684 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
RRP1BQ14684 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
RRP1BQ14684 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
RRP1BQ14684 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
RRP1BQ14684 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
RRP1BQ14684 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
RRP1BQ14684 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
RRP1BQ14684 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
RRP1BQ14684 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
RRP1BQ14684 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
RRP1BQ14684 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
RRP1BQ14684 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
RRP1BQ14684 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
RRP1BQ14684 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
RRP1BQ14684 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
RRP1BQ14684 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
RRP1BQ14684 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
RRP1BQ14684 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
RRP1BQ14684 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
RRP1BQ14684 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
RRP1BQ14684 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
RRP1BQ14684 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
RRP1BQ14684 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
RRP1BQ14684 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
RRP1BQ14684 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
RRP1BQ14684 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
RRP1BQ14684 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
RRP1BQ14684 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
RRP1BQ14684 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
RRP1BQ14684 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
RRP1BQ14684 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
RRP1BQ14684 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
RRP1BQ14684 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
RRP1BQ14684 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
RRP1BQ14684 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
RRP1BQ14684 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
RRP1BQ14684 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
RRP1BQ14684 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
RRP1BQ14684 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
RRP1BQ14684 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
RRP1BQ14684 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
RRP1BQ14684 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
RRP1BQ14684 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
RRP1BQ14684 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
RRP1BQ14684 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
RRP1BQ14684 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
RRP1BQ14684 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
RRP1BQ14684 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
RRP1BQ14684 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
RRP1BQ14684 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
RRP1BQ14684 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
RRP1BQ14684 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
RRP1BQ14684 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
RRP1BQ14684 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
RRP1BQ14684 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
RRP1BQ14684 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
RRP1BQ14684 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
RRP1BQ14684 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
RRP1BQ14684 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
RRP1BQ14684 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
RRP1BQ14684 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
RRP1BQ14684 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
RRP1BQ14684 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
RRP1BQ14684 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
RRP1BQ14684 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
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