Protein–RNA interactions for Protein: Q14055

COL9A2, Collagen alpha-2(IX) chain, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 689 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL9A2Q14055 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
COL9A2Q14055 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
COL9A2Q14055 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
COL9A2Q14055 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
COL9A2Q14055 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
COL9A2Q14055 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC20.99■□□□□ 0.95
COL9A2Q14055 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
COL9A2Q14055 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
COL9A2Q14055 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
COL9A2Q14055 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
COL9A2Q14055 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
COL9A2Q14055 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
COL9A2Q14055 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
COL9A2Q14055 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
COL9A2Q14055 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
COL9A2Q14055 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
COL9A2Q14055 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
COL9A2Q14055 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
COL9A2Q14055 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
COL9A2Q14055 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
COL9A2Q14055 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
COL9A2Q14055 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
COL9A2Q14055 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
COL9A2Q14055 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
COL9A2Q14055 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
COL9A2Q14055 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
COL9A2Q14055 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
COL9A2Q14055 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
COL9A2Q14055 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
COL9A2Q14055 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
COL9A2Q14055 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
COL9A2Q14055 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
COL9A2Q14055 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
COL9A2Q14055 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
COL9A2Q14055 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
COL9A2Q14055 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
COL9A2Q14055 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
COL9A2Q14055 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
COL9A2Q14055 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
COL9A2Q14055 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
COL9A2Q14055 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
COL9A2Q14055 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
COL9A2Q14055 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
COL9A2Q14055 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
COL9A2Q14055 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
COL9A2Q14055 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
COL9A2Q14055 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
COL9A2Q14055 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
COL9A2Q14055 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
COL9A2Q14055 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
COL9A2Q14055 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
COL9A2Q14055 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
COL9A2Q14055 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
COL9A2Q14055 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
COL9A2Q14055 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
COL9A2Q14055 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
COL9A2Q14055 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
COL9A2Q14055 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
COL9A2Q14055 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
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COL9A2Q14055 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
COL9A2Q14055 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
COL9A2Q14055 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
COL9A2Q14055 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.95
COL9A2Q14055 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
COL9A2Q14055 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
COL9A2Q14055 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
COL9A2Q14055 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
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COL9A2Q14055 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC20.95■□□□□ 0.94
COL9A2Q14055 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
COL9A2Q14055 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
COL9A2Q14055 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
COL9A2Q14055 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
COL9A2Q14055 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
COL9A2Q14055 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
COL9A2Q14055 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC20.94■□□□□ 0.94
COL9A2Q14055 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
COL9A2Q14055 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC20.94■□□□□ 0.94
COL9A2Q14055 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
COL9A2Q14055 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
COL9A2Q14055 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
COL9A2Q14055 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
COL9A2Q14055 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
COL9A2Q14055 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
COL9A2Q14055 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
COL9A2Q14055 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
COL9A2Q14055 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
COL9A2Q14055 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
COL9A2Q14055 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
COL9A2Q14055 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
COL9A2Q14055 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
COL9A2Q14055 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
COL9A2Q14055 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
COL9A2Q14055 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
COL9A2Q14055 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
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