Protein–RNA interactions for Protein: Q14050

COL9A3, Collagen alpha-3(IX) chain, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 684 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL9A3Q14050 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
COL9A3Q14050 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
COL9A3Q14050 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
COL9A3Q14050 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
COL9A3Q14050 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
COL9A3Q14050 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
COL9A3Q14050 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
COL9A3Q14050 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
COL9A3Q14050 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
COL9A3Q14050 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
COL9A3Q14050 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
COL9A3Q14050 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
COL9A3Q14050 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
COL9A3Q14050 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
COL9A3Q14050 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
COL9A3Q14050 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
COL9A3Q14050 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
COL9A3Q14050 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC25.63■■□□□ 1.69
COL9A3Q14050 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
COL9A3Q14050 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
COL9A3Q14050 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
COL9A3Q14050 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
COL9A3Q14050 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
COL9A3Q14050 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
COL9A3Q14050 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
COL9A3Q14050 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
COL9A3Q14050 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
COL9A3Q14050 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
COL9A3Q14050 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
COL9A3Q14050 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
COL9A3Q14050 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
COL9A3Q14050 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
COL9A3Q14050 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
COL9A3Q14050 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
COL9A3Q14050 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
COL9A3Q14050 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
COL9A3Q14050 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
COL9A3Q14050 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
COL9A3Q14050 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
COL9A3Q14050 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
COL9A3Q14050 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
COL9A3Q14050 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
COL9A3Q14050 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC25.61■■□□□ 1.69
COL9A3Q14050 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
COL9A3Q14050 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
COL9A3Q14050 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.61■■□□□ 1.69
COL9A3Q14050 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
COL9A3Q14050 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
COL9A3Q14050 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
COL9A3Q14050 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
COL9A3Q14050 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
COL9A3Q14050 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
COL9A3Q14050 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
COL9A3Q14050 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
COL9A3Q14050 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
COL9A3Q14050 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
COL9A3Q14050 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
COL9A3Q14050 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
COL9A3Q14050 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
COL9A3Q14050 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
COL9A3Q14050 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
COL9A3Q14050 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
COL9A3Q14050 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
COL9A3Q14050 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
COL9A3Q14050 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
COL9A3Q14050 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
COL9A3Q14050 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
COL9A3Q14050 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
COL9A3Q14050 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
COL9A3Q14050 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
COL9A3Q14050 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
COL9A3Q14050 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
COL9A3Q14050 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
COL9A3Q14050 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
COL9A3Q14050 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
COL9A3Q14050 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
COL9A3Q14050 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
COL9A3Q14050 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.68
COL9A3Q14050 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
COL9A3Q14050 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
COL9A3Q14050 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
COL9A3Q14050 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
COL9A3Q14050 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
COL9A3Q14050 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
COL9A3Q14050 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
COL9A3Q14050 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
COL9A3Q14050 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
COL9A3Q14050 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
COL9A3Q14050 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
COL9A3Q14050 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
COL9A3Q14050 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
COL9A3Q14050 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
COL9A3Q14050 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
COL9A3Q14050 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
COL9A3Q14050 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
COL9A3Q14050 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
COL9A3Q14050 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
COL9A3Q14050 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
COL9A3Q14050 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
COL9A3Q14050 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
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