Protein–RNA interactions for Protein: Q13956

PDE6H, Retinal cone rhodopsin-sensitive cGMP 3',5'-cyclic phosphodiesterase subunit gamma, humanhuman

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Length 83 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE6HQ13956 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PDE6HQ13956 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
PDE6HQ13956 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PDE6HQ13956 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PDE6HQ13956 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PDE6HQ13956 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PDE6HQ13956 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PDE6HQ13956 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PDE6HQ13956 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PDE6HQ13956 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PDE6HQ13956 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PDE6HQ13956 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PDE6HQ13956 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
PDE6HQ13956 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PDE6HQ13956 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PDE6HQ13956 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PDE6HQ13956 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PDE6HQ13956 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PDE6HQ13956 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PDE6HQ13956 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PDE6HQ13956 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PDE6HQ13956 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PDE6HQ13956 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PDE6HQ13956 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PDE6HQ13956 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PDE6HQ13956 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PDE6HQ13956 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PDE6HQ13956 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PDE6HQ13956 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PDE6HQ13956 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PDE6HQ13956 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
PDE6HQ13956 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PDE6HQ13956 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PDE6HQ13956 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PDE6HQ13956 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PDE6HQ13956 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PDE6HQ13956 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PDE6HQ13956 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PDE6HQ13956 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PDE6HQ13956 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PDE6HQ13956 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PDE6HQ13956 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PDE6HQ13956 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PDE6HQ13956 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PDE6HQ13956 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PDE6HQ13956 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PDE6HQ13956 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PDE6HQ13956 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PDE6HQ13956 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
PDE6HQ13956 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
PDE6HQ13956 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PDE6HQ13956 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PDE6HQ13956 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PDE6HQ13956 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PDE6HQ13956 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PDE6HQ13956 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PDE6HQ13956 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
PDE6HQ13956 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
PDE6HQ13956 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
PDE6HQ13956 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.22
PDE6HQ13956 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PDE6HQ13956 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PDE6HQ13956 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PDE6HQ13956 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PDE6HQ13956 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PDE6HQ13956 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PDE6HQ13956 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PDE6HQ13956 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PDE6HQ13956 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PDE6HQ13956 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PDE6HQ13956 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PDE6HQ13956 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PDE6HQ13956 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
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PDE6HQ13956 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PDE6HQ13956 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PDE6HQ13956 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PDE6HQ13956 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PDE6HQ13956 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PDE6HQ13956 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
PDE6HQ13956 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PDE6HQ13956 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PDE6HQ13956 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PDE6HQ13956 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
PDE6HQ13956 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PDE6HQ13956 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PDE6HQ13956 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PDE6HQ13956 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PDE6HQ13956 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PDE6HQ13956 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
PDE6HQ13956 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PDE6HQ13956 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PDE6HQ13956 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PDE6HQ13956 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PDE6HQ13956 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PDE6HQ13956 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PDE6HQ13956 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PDE6HQ13956 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PDE6HQ13956 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PDE6HQ13956 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
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