Protein–RNA interactions for Protein: Q13796

SHROOM2, Protein Shroom2, humanhuman

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Length 1,616 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHROOM2Q13796 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.97■■■■□ 3.19
SHROOM2Q13796 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC34.97■■■■□ 3.19
SHROOM2Q13796 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC34.96■■■■□ 3.19
SHROOM2Q13796 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.96■■■■□ 3.19
SHROOM2Q13796 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.96■■■■□ 3.19
SHROOM2Q13796 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC34.96■■■■□ 3.19
SHROOM2Q13796 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.96■■■■□ 3.19
SHROOM2Q13796 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC34.96■■■■□ 3.19
SHROOM2Q13796 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC34.96■■■■□ 3.19
SHROOM2Q13796 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.96■■■■□ 3.19
SHROOM2Q13796 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC34.96■■■■□ 3.19
SHROOM2Q13796 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.96■■■■□ 3.19
SHROOM2Q13796 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.96■■■■□ 3.19
SHROOM2Q13796 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC34.95■■■■□ 3.19
SHROOM2Q13796 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC34.95■■■■□ 3.19
SHROOM2Q13796 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC34.95■■■■□ 3.19
SHROOM2Q13796 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.95■■■■□ 3.19
SHROOM2Q13796 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.95■■■■□ 3.18
SHROOM2Q13796 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC34.95■■■■□ 3.18
SHROOM2Q13796 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC34.94■■■■□ 3.18
SHROOM2Q13796 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC34.94■■■■□ 3.18
SHROOM2Q13796 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.94■■■■□ 3.18
SHROOM2Q13796 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC34.94■■■■□ 3.18
SHROOM2Q13796 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC34.94■■■■□ 3.18
SHROOM2Q13796 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC34.94■■■■□ 3.18
SHROOM2Q13796 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.94■■■■□ 3.18
SHROOM2Q13796 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC34.94■■■■□ 3.18
SHROOM2Q13796 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC34.94■■■■□ 3.18
SHROOM2Q13796 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC34.94■■■■□ 3.18
SHROOM2Q13796 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC34.94■■■■□ 3.18
SHROOM2Q13796 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.94■■■■□ 3.18
SHROOM2Q13796 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC34.94■■■■□ 3.18
SHROOM2Q13796 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.94■■■■□ 3.18
SHROOM2Q13796 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC34.94■■■■□ 3.18
SHROOM2Q13796 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.93■■■■□ 3.18
SHROOM2Q13796 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC34.93■■■■□ 3.18
SHROOM2Q13796 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC34.93■■■■□ 3.18
SHROOM2Q13796 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC34.93■■■■□ 3.18
SHROOM2Q13796 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.92■■■■□ 3.18
SHROOM2Q13796 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC34.92■■■■□ 3.18
SHROOM2Q13796 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC34.92■■■■□ 3.18
SHROOM2Q13796 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC34.92■■■■□ 3.18
SHROOM2Q13796 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC34.92■■■■□ 3.18
SHROOM2Q13796 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.92■■■■□ 3.18
SHROOM2Q13796 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC34.92■■■■□ 3.18
SHROOM2Q13796 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC34.92■■■■□ 3.18
SHROOM2Q13796 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC34.91■■■■□ 3.18
SHROOM2Q13796 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.91■■■■□ 3.18
SHROOM2Q13796 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.91■■■■□ 3.18
SHROOM2Q13796 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC34.91■■■■□ 3.18
SHROOM2Q13796 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC34.91■■■■□ 3.18
SHROOM2Q13796 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC34.91■■■■□ 3.18
SHROOM2Q13796 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC34.91■■■■□ 3.18
SHROOM2Q13796 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.9■■■■□ 3.18
SHROOM2Q13796 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC34.9■■■■□ 3.18
SHROOM2Q13796 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC34.9■■■■□ 3.18
SHROOM2Q13796 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC34.9■■■■□ 3.18
SHROOM2Q13796 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.89■■■■□ 3.18
SHROOM2Q13796 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC34.89■■■■□ 3.18
SHROOM2Q13796 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC34.89■■■■□ 3.18
SHROOM2Q13796 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC34.89■■■■□ 3.18
SHROOM2Q13796 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC34.89■■■■□ 3.18
SHROOM2Q13796 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC34.89■■■■□ 3.18
SHROOM2Q13796 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.88■■■■□ 3.17
SHROOM2Q13796 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.88■■■■□ 3.17
SHROOM2Q13796 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC34.88■■■■□ 3.17
SHROOM2Q13796 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC34.88■■■■□ 3.17
SHROOM2Q13796 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.88■■■■□ 3.17
SHROOM2Q13796 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC34.88■■■■□ 3.17
SHROOM2Q13796 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC34.88■■■■□ 3.17
SHROOM2Q13796 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC34.88■■■■□ 3.17
SHROOM2Q13796 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC34.88■■■■□ 3.17
SHROOM2Q13796 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC34.88■■■■□ 3.17
SHROOM2Q13796 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC34.87■■■■□ 3.17
SHROOM2Q13796 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.87■■■■□ 3.17
SHROOM2Q13796 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.87■■■■□ 3.17
SHROOM2Q13796 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC34.87■■■■□ 3.17
SHROOM2Q13796 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC34.87■■■■□ 3.17
SHROOM2Q13796 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC34.86■■■■□ 3.17
SHROOM2Q13796 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.86■■■■□ 3.17
SHROOM2Q13796 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.86■■■■□ 3.17
SHROOM2Q13796 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC34.86■■■■□ 3.17
SHROOM2Q13796 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.86■■■■□ 3.17
SHROOM2Q13796 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.86■■■■□ 3.17
SHROOM2Q13796 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC34.86■■■■□ 3.17
SHROOM2Q13796 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.86■■■■□ 3.17
SHROOM2Q13796 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.86■■■■□ 3.17
SHROOM2Q13796 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.86■■■■□ 3.17
SHROOM2Q13796 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.85■■■■□ 3.17
SHROOM2Q13796 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC34.85■■■■□ 3.17
SHROOM2Q13796 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC34.85■■■■□ 3.17
SHROOM2Q13796 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.85■■■■□ 3.17
SHROOM2Q13796 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC34.85■■■■□ 3.17
SHROOM2Q13796 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC34.85■■■■□ 3.17
SHROOM2Q13796 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC34.85■■■■□ 3.17
SHROOM2Q13796 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.85■■■■□ 3.17
SHROOM2Q13796 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC34.85■■■■□ 3.17
SHROOM2Q13796 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC34.85■■■■□ 3.17
SHROOM2Q13796 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.85■■■■□ 3.17
SHROOM2Q13796 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC34.84■■■■□ 3.17
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