Protein–RNA interactions for Protein: Q13620

CUL4B, Cullin-4B, humanhuman

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Length 913 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL4BQ13620 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CUL4BQ13620 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CUL4BQ13620 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CUL4BQ13620 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CUL4BQ13620 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CUL4BQ13620 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CUL4BQ13620 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CUL4BQ13620 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
CUL4BQ13620 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CUL4BQ13620 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CUL4BQ13620 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CUL4BQ13620 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CUL4BQ13620 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CUL4BQ13620 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CUL4BQ13620 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CUL4BQ13620 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CUL4BQ13620 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CUL4BQ13620 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CUL4BQ13620 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
CUL4BQ13620 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CUL4BQ13620 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CUL4BQ13620 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CUL4BQ13620 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CUL4BQ13620 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CUL4BQ13620 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CUL4BQ13620 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CUL4BQ13620 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CUL4BQ13620 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CUL4BQ13620 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CUL4BQ13620 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CUL4BQ13620 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CUL4BQ13620 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CUL4BQ13620 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
CUL4BQ13620 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CUL4BQ13620 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CUL4BQ13620 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CUL4BQ13620 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CUL4BQ13620 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
CUL4BQ13620 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CUL4BQ13620 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CUL4BQ13620 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CUL4BQ13620 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CUL4BQ13620 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CUL4BQ13620 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CUL4BQ13620 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CUL4BQ13620 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CUL4BQ13620 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CUL4BQ13620 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CUL4BQ13620 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CUL4BQ13620 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CUL4BQ13620 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CUL4BQ13620 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CUL4BQ13620 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CUL4BQ13620 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CUL4BQ13620 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CUL4BQ13620 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CUL4BQ13620 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CUL4BQ13620 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CUL4BQ13620 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CUL4BQ13620 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
CUL4BQ13620 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
CUL4BQ13620 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
CUL4BQ13620 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
CUL4BQ13620 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CUL4BQ13620 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CUL4BQ13620 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CUL4BQ13620 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CUL4BQ13620 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CUL4BQ13620 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CUL4BQ13620 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CUL4BQ13620 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CUL4BQ13620 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
CUL4BQ13620 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CUL4BQ13620 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CUL4BQ13620 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CUL4BQ13620 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CUL4BQ13620 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CUL4BQ13620 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
CUL4BQ13620 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CUL4BQ13620 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CUL4BQ13620 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CUL4BQ13620 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CUL4BQ13620 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
CUL4BQ13620 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CUL4BQ13620 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CUL4BQ13620 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
CUL4BQ13620 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CUL4BQ13620 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CUL4BQ13620 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CUL4BQ13620 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CUL4BQ13620 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CUL4BQ13620 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CUL4BQ13620 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CUL4BQ13620 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CUL4BQ13620 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CUL4BQ13620 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
CUL4BQ13620 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CUL4BQ13620 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CUL4BQ13620 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CUL4BQ13620 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
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