Protein–RNA interactions for Protein: Q13562

NEUROD1, Neurogenic differentiation factor 1, humanhuman

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Length 356 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEUROD1Q13562 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.81■■■□□ 2.68
NEUROD1Q13562 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC31.81■■■□□ 2.68
NEUROD1Q13562 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC31.81■■■□□ 2.68
NEUROD1Q13562 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.81■■■□□ 2.68
NEUROD1Q13562 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC31.81■■■□□ 2.68
NEUROD1Q13562 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC31.81■■■□□ 2.68
NEUROD1Q13562 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC31.81■■■□□ 2.68
NEUROD1Q13562 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.81■■■□□ 2.68
NEUROD1Q13562 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.81■■■□□ 2.68
NEUROD1Q13562 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.8■■■□□ 2.68
NEUROD1Q13562 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.8■■■□□ 2.68
NEUROD1Q13562 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC31.8■■■□□ 2.68
NEUROD1Q13562 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC31.8■■■□□ 2.68
NEUROD1Q13562 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC31.8■■■□□ 2.68
NEUROD1Q13562 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC31.8■■■□□ 2.68
NEUROD1Q13562 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC31.8■■■□□ 2.68
NEUROD1Q13562 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC31.8■■■□□ 2.68
NEUROD1Q13562 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.8■■■□□ 2.68
NEUROD1Q13562 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.8■■■□□ 2.68
NEUROD1Q13562 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.8■■■□□ 2.68
NEUROD1Q13562 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC31.8■■■□□ 2.68
NEUROD1Q13562 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.8■■■□□ 2.68
NEUROD1Q13562 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.8■■■□□ 2.68
NEUROD1Q13562 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.79■■■□□ 2.68
NEUROD1Q13562 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC31.79■■■□□ 2.68
NEUROD1Q13562 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC31.79■■■□□ 2.68
NEUROD1Q13562 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC31.79■■■□□ 2.68
NEUROD1Q13562 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.79■■■□□ 2.68
NEUROD1Q13562 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.79■■■□□ 2.68
NEUROD1Q13562 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC31.79■■■□□ 2.68
NEUROD1Q13562 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.79■■■□□ 2.68
NEUROD1Q13562 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC31.79■■■□□ 2.68
NEUROD1Q13562 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC31.79■■■□□ 2.68
NEUROD1Q13562 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC31.79■■■□□ 2.68
NEUROD1Q13562 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.78■■■□□ 2.68
NEUROD1Q13562 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.78■■■□□ 2.68
NEUROD1Q13562 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC31.78■■■□□ 2.68
NEUROD1Q13562 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC31.78■■■□□ 2.68
NEUROD1Q13562 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC31.78■■■□□ 2.68
NEUROD1Q13562 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC31.78■■■□□ 2.68
NEUROD1Q13562 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC31.78■■■□□ 2.68
NEUROD1Q13562 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.78■■■□□ 2.68
NEUROD1Q13562 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC31.78■■■□□ 2.68
NEUROD1Q13562 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
NEUROD1Q13562 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
NEUROD1Q13562 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
NEUROD1Q13562 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
NEUROD1Q13562 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC31.77■■■□□ 2.68
NEUROD1Q13562 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.77■■■□□ 2.68
NEUROD1Q13562 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
NEUROD1Q13562 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.77■■■□□ 2.68
NEUROD1Q13562 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC31.77■■■□□ 2.68
NEUROD1Q13562 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.67
NEUROD1Q13562 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.76■■■□□ 2.67
NEUROD1Q13562 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.67
NEUROD1Q13562 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.67
NEUROD1Q13562 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC31.76■■■□□ 2.67
NEUROD1Q13562 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.67
NEUROD1Q13562 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC31.76■■■□□ 2.67
NEUROD1Q13562 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC31.76■■■□□ 2.67
NEUROD1Q13562 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.67
NEUROD1Q13562 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.76■■■□□ 2.67
NEUROD1Q13562 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.67
NEUROD1Q13562 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC31.75■■■□□ 2.67
NEUROD1Q13562 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC31.75■■■□□ 2.67
NEUROD1Q13562 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
NEUROD1Q13562 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
NEUROD1Q13562 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC31.75■■■□□ 2.67
NEUROD1Q13562 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
NEUROD1Q13562 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
NEUROD1Q13562 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
NEUROD1Q13562 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
NEUROD1Q13562 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
NEUROD1Q13562 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
NEUROD1Q13562 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC31.74■■■□□ 2.67
NEUROD1Q13562 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
NEUROD1Q13562 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC31.74■■■□□ 2.67
NEUROD1Q13562 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
NEUROD1Q13562 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
NEUROD1Q13562 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
NEUROD1Q13562 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
NEUROD1Q13562 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
NEUROD1Q13562 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC31.73■■■□□ 2.67
NEUROD1Q13562 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC31.73■■■□□ 2.67
NEUROD1Q13562 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC31.73■■■□□ 2.67
NEUROD1Q13562 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
NEUROD1Q13562 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC31.73■■■□□ 2.67
NEUROD1Q13562 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC31.73■■■□□ 2.67
NEUROD1Q13562 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
NEUROD1Q13562 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
NEUROD1Q13562 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
NEUROD1Q13562 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
NEUROD1Q13562 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
NEUROD1Q13562 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
NEUROD1Q13562 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
NEUROD1Q13562 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
NEUROD1Q13562 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC31.72■■■□□ 2.67
NEUROD1Q13562 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC31.72■■■□□ 2.67
NEUROD1Q13562 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC31.72■■■□□ 2.67
NEUROD1Q13562 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
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