Protein–RNA interactions for Protein: Q13461

FOXE3, Forkhead box protein E3, humanhuman

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Length 319 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXE3Q13461 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
FOXE3Q13461 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
FOXE3Q13461 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
FOXE3Q13461 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
FOXE3Q13461 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
FOXE3Q13461 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
FOXE3Q13461 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
FOXE3Q13461 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
FOXE3Q13461 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
FOXE3Q13461 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
FOXE3Q13461 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
FOXE3Q13461 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
FOXE3Q13461 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
FOXE3Q13461 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
FOXE3Q13461 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
FOXE3Q13461 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
FOXE3Q13461 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
FOXE3Q13461 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
FOXE3Q13461 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
FOXE3Q13461 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
FOXE3Q13461 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
FOXE3Q13461 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
FOXE3Q13461 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
FOXE3Q13461 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
FOXE3Q13461 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
FOXE3Q13461 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
FOXE3Q13461 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
FOXE3Q13461 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
FOXE3Q13461 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
FOXE3Q13461 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
FOXE3Q13461 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
FOXE3Q13461 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
FOXE3Q13461 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
FOXE3Q13461 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
FOXE3Q13461 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
FOXE3Q13461 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
FOXE3Q13461 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.97■□□□□ 0.31
FOXE3Q13461 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
FOXE3Q13461 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC16.97■□□□□ 0.31
FOXE3Q13461 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
FOXE3Q13461 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
FOXE3Q13461 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
FOXE3Q13461 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
FOXE3Q13461 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
FOXE3Q13461 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
FOXE3Q13461 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
FOXE3Q13461 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
FOXE3Q13461 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
FOXE3Q13461 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
FOXE3Q13461 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
FOXE3Q13461 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
FOXE3Q13461 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
FOXE3Q13461 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
FOXE3Q13461 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
FOXE3Q13461 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC16.96■□□□□ 0.31
FOXE3Q13461 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
FOXE3Q13461 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
FOXE3Q13461 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
FOXE3Q13461 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
FOXE3Q13461 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
FOXE3Q13461 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
FOXE3Q13461 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
FOXE3Q13461 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
FOXE3Q13461 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC16.96■□□□□ 0.3
FOXE3Q13461 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
FOXE3Q13461 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
FOXE3Q13461 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
FOXE3Q13461 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
FOXE3Q13461 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
FOXE3Q13461 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
FOXE3Q13461 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
FOXE3Q13461 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
FOXE3Q13461 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
FOXE3Q13461 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
FOXE3Q13461 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
FOXE3Q13461 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC16.95■□□□□ 0.3
FOXE3Q13461 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
FOXE3Q13461 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
FOXE3Q13461 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
FOXE3Q13461 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
FOXE3Q13461 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
FOXE3Q13461 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
FOXE3Q13461 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
FOXE3Q13461 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
FOXE3Q13461 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
FOXE3Q13461 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
FOXE3Q13461 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
FOXE3Q13461 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
FOXE3Q13461 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
FOXE3Q13461 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
FOXE3Q13461 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
FOXE3Q13461 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
FOXE3Q13461 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
FOXE3Q13461 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
FOXE3Q13461 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
FOXE3Q13461 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC16.94■□□□□ 0.3
FOXE3Q13461 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
FOXE3Q13461 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
FOXE3Q13461 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
FOXE3Q13461 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
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