Protein–RNA interactions for Protein: Q13286

CLN3, Battenin, humanhuman

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Length 438 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN3Q13286 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
CLN3Q13286 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
CLN3Q13286 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
CLN3Q13286 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
CLN3Q13286 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
CLN3Q13286 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CLN3Q13286 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CLN3Q13286 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CLN3Q13286 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CLN3Q13286 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CLN3Q13286 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CLN3Q13286 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CLN3Q13286 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CLN3Q13286 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CLN3Q13286 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CLN3Q13286 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CLN3Q13286 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CLN3Q13286 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CLN3Q13286 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CLN3Q13286 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CLN3Q13286 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CLN3Q13286 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CLN3Q13286 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CLN3Q13286 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CLN3Q13286 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CLN3Q13286 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CLN3Q13286 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CLN3Q13286 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CLN3Q13286 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CLN3Q13286 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CLN3Q13286 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CLN3Q13286 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CLN3Q13286 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CLN3Q13286 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CLN3Q13286 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CLN3Q13286 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CLN3Q13286 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CLN3Q13286 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CLN3Q13286 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CLN3Q13286 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CLN3Q13286 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CLN3Q13286 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CLN3Q13286 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CLN3Q13286 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
CLN3Q13286 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CLN3Q13286 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CLN3Q13286 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CLN3Q13286 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CLN3Q13286 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CLN3Q13286 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CLN3Q13286 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CLN3Q13286 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CLN3Q13286 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CLN3Q13286 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CLN3Q13286 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CLN3Q13286 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CLN3Q13286 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
CLN3Q13286 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CLN3Q13286 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CLN3Q13286 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
CLN3Q13286 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CLN3Q13286 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CLN3Q13286 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CLN3Q13286 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CLN3Q13286 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CLN3Q13286 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CLN3Q13286 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CLN3Q13286 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
CLN3Q13286 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CLN3Q13286 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CLN3Q13286 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CLN3Q13286 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CLN3Q13286 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CLN3Q13286 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CLN3Q13286 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CLN3Q13286 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CLN3Q13286 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CLN3Q13286 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CLN3Q13286 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CLN3Q13286 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
CLN3Q13286 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
CLN3Q13286 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CLN3Q13286 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CLN3Q13286 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CLN3Q13286 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CLN3Q13286 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
CLN3Q13286 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CLN3Q13286 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CLN3Q13286 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
CLN3Q13286 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CLN3Q13286 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CLN3Q13286 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CLN3Q13286 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CLN3Q13286 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CLN3Q13286 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CLN3Q13286 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CLN3Q13286 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CLN3Q13286 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CLN3Q13286 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CLN3Q13286 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
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