Protein–RNA interactions for Protein: Q13115

DUSP4, Dual specificity protein phosphatase 4, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP4Q13115 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
DUSP4Q13115 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
DUSP4Q13115 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
DUSP4Q13115 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
DUSP4Q13115 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
DUSP4Q13115 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
DUSP4Q13115 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
DUSP4Q13115 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
DUSP4Q13115 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
DUSP4Q13115 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
DUSP4Q13115 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
DUSP4Q13115 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
DUSP4Q13115 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
DUSP4Q13115 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
DUSP4Q13115 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
DUSP4Q13115 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
DUSP4Q13115 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
DUSP4Q13115 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.23
DUSP4Q13115 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
DUSP4Q13115 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
DUSP4Q13115 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
DUSP4Q13115 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
DUSP4Q13115 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
DUSP4Q13115 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
DUSP4Q13115 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
DUSP4Q13115 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
DUSP4Q13115 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
DUSP4Q13115 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
DUSP4Q13115 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC22.76■■□□□ 1.23
DUSP4Q13115 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
DUSP4Q13115 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
DUSP4Q13115 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
DUSP4Q13115 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
DUSP4Q13115 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
DUSP4Q13115 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
DUSP4Q13115 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
DUSP4Q13115 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
DUSP4Q13115 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
DUSP4Q13115 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
DUSP4Q13115 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
DUSP4Q13115 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
DUSP4Q13115 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
DUSP4Q13115 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
DUSP4Q13115 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
DUSP4Q13115 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
DUSP4Q13115 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
DUSP4Q13115 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
DUSP4Q13115 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
DUSP4Q13115 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
DUSP4Q13115 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
DUSP4Q13115 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
DUSP4Q13115 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
DUSP4Q13115 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
DUSP4Q13115 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
DUSP4Q13115 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
DUSP4Q13115 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
DUSP4Q13115 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
DUSP4Q13115 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
DUSP4Q13115 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
DUSP4Q13115 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC22.73■■□□□ 1.23
DUSP4Q13115 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
DUSP4Q13115 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
DUSP4Q13115 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
DUSP4Q13115 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
DUSP4Q13115 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
DUSP4Q13115 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
DUSP4Q13115 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
DUSP4Q13115 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
DUSP4Q13115 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
DUSP4Q13115 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
DUSP4Q13115 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
DUSP4Q13115 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
DUSP4Q13115 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
DUSP4Q13115 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
DUSP4Q13115 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
DUSP4Q13115 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
DUSP4Q13115 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
DUSP4Q13115 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
DUSP4Q13115 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
DUSP4Q13115 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
DUSP4Q13115 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
DUSP4Q13115 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
DUSP4Q13115 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
DUSP4Q13115 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
DUSP4Q13115 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
DUSP4Q13115 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
DUSP4Q13115 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
DUSP4Q13115 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
DUSP4Q13115 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
DUSP4Q13115 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
DUSP4Q13115 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
DUSP4Q13115 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
DUSP4Q13115 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
DUSP4Q13115 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
DUSP4Q13115 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
DUSP4Q13115 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
DUSP4Q13115 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
DUSP4Q13115 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
DUSP4Q13115 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
DUSP4Q13115 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
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