Protein–RNA interactions for Protein: Q12986

NFX1, Transcriptional repressor NF-X1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,120 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFX1Q12986 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
NFX1Q12986 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
NFX1Q12986 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
NFX1Q12986 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
NFX1Q12986 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC23.81■■□□□ 1.4
NFX1Q12986 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
NFX1Q12986 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
NFX1Q12986 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
NFX1Q12986 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
NFX1Q12986 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
NFX1Q12986 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
NFX1Q12986 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
NFX1Q12986 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
NFX1Q12986 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
NFX1Q12986 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
NFX1Q12986 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
NFX1Q12986 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
NFX1Q12986 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
NFX1Q12986 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
NFX1Q12986 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
NFX1Q12986 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
NFX1Q12986 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
NFX1Q12986 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
NFX1Q12986 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
NFX1Q12986 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
NFX1Q12986 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
NFX1Q12986 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
NFX1Q12986 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
NFX1Q12986 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
NFX1Q12986 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
NFX1Q12986 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
NFX1Q12986 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
NFX1Q12986 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
NFX1Q12986 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
NFX1Q12986 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
NFX1Q12986 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
NFX1Q12986 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
NFX1Q12986 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
NFX1Q12986 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
NFX1Q12986 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
NFX1Q12986 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
NFX1Q12986 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
NFX1Q12986 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
NFX1Q12986 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
NFX1Q12986 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
NFX1Q12986 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
NFX1Q12986 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
NFX1Q12986 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
NFX1Q12986 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC23.77■■□□□ 1.4
NFX1Q12986 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
NFX1Q12986 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
NFX1Q12986 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
NFX1Q12986 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
NFX1Q12986 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
NFX1Q12986 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
NFX1Q12986 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
NFX1Q12986 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
NFX1Q12986 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
NFX1Q12986 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
NFX1Q12986 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
NFX1Q12986 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
NFX1Q12986 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
NFX1Q12986 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
NFX1Q12986 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
NFX1Q12986 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
NFX1Q12986 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
NFX1Q12986 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
NFX1Q12986 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
NFX1Q12986 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
NFX1Q12986 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
NFX1Q12986 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
NFX1Q12986 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
NFX1Q12986 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
NFX1Q12986 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
NFX1Q12986 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
NFX1Q12986 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
NFX1Q12986 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
NFX1Q12986 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC23.74■■□□□ 1.39
NFX1Q12986 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
NFX1Q12986 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
NFX1Q12986 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
NFX1Q12986 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
NFX1Q12986 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
NFX1Q12986 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
NFX1Q12986 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
NFX1Q12986 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
NFX1Q12986 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
NFX1Q12986 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
NFX1Q12986 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
NFX1Q12986 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
NFX1Q12986 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
NFX1Q12986 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
NFX1Q12986 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
NFX1Q12986 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
NFX1Q12986 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
NFX1Q12986 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
NFX1Q12986 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
NFX1Q12986 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
NFX1Q12986 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
NFX1Q12986 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
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