Protein–RNA interactions for Protein: Q12872

SFSWAP, Splicing factor, suppressor of white-apricot homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 951 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFSWAPQ12872 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SFSWAPQ12872 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SFSWAPQ12872 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
SFSWAPQ12872 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SFSWAPQ12872 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SFSWAPQ12872 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SFSWAPQ12872 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SFSWAPQ12872 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SFSWAPQ12872 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
SFSWAPQ12872 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SFSWAPQ12872 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
SFSWAPQ12872 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
SFSWAPQ12872 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SFSWAPQ12872 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SFSWAPQ12872 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SFSWAPQ12872 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SFSWAPQ12872 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
SFSWAPQ12872 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SFSWAPQ12872 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SFSWAPQ12872 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SFSWAPQ12872 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SFSWAPQ12872 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SFSWAPQ12872 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SFSWAPQ12872 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SFSWAPQ12872 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SFSWAPQ12872 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SFSWAPQ12872 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SFSWAPQ12872 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SFSWAPQ12872 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SFSWAPQ12872 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SFSWAPQ12872 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SFSWAPQ12872 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SFSWAPQ12872 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SFSWAPQ12872 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SFSWAPQ12872 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SFSWAPQ12872 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SFSWAPQ12872 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SFSWAPQ12872 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SFSWAPQ12872 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SFSWAPQ12872 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SFSWAPQ12872 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SFSWAPQ12872 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SFSWAPQ12872 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SFSWAPQ12872 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SFSWAPQ12872 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SFSWAPQ12872 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
SFSWAPQ12872 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
SFSWAPQ12872 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SFSWAPQ12872 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
SFSWAPQ12872 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SFSWAPQ12872 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SFSWAPQ12872 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
SFSWAPQ12872 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SFSWAPQ12872 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SFSWAPQ12872 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SFSWAPQ12872 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SFSWAPQ12872 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SFSWAPQ12872 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SFSWAPQ12872 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SFSWAPQ12872 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SFSWAPQ12872 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SFSWAPQ12872 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SFSWAPQ12872 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SFSWAPQ12872 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SFSWAPQ12872 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SFSWAPQ12872 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
SFSWAPQ12872 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SFSWAPQ12872 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SFSWAPQ12872 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
SFSWAPQ12872 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC21.83■■□□□ 1.08
SFSWAPQ12872 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
SFSWAPQ12872 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
SFSWAPQ12872 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SFSWAPQ12872 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SFSWAPQ12872 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SFSWAPQ12872 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SFSWAPQ12872 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SFSWAPQ12872 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SFSWAPQ12872 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SFSWAPQ12872 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SFSWAPQ12872 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
SFSWAPQ12872 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SFSWAPQ12872 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SFSWAPQ12872 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SFSWAPQ12872 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SFSWAPQ12872 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SFSWAPQ12872 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SFSWAPQ12872 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SFSWAPQ12872 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SFSWAPQ12872 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SFSWAPQ12872 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SFSWAPQ12872 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SFSWAPQ12872 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SFSWAPQ12872 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SFSWAPQ12872 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SFSWAPQ12872 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SFSWAPQ12872 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SFSWAPQ12872 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SFSWAPQ12872 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SFSWAPQ12872 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
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