Protein–RNA interactions for Protein: Q12347

HRT3, F-box protein HRT3, yeastyeast

Predictions only

Length 344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
HRT3Q12347 UBX5YDR330W 1503 nt3.64□□□□□ -1.83
HRT3Q12347 YDL032WYDL032W 312 nt3.63□□□□□ -1.83
HRT3Q12347 GTF1YGR102C 552 nt3.63□□□□□ -1.83
HRT3Q12347 YAL064WYAL064W 285 nt3.63□□□□□ -1.83
HRT3Q12347 YLR462WYLR462W 609 nt3.63□□□□□ -1.83
HRT3Q12347 MOH1YBL049W 417 nt3.63□□□□□ -1.83
HRT3Q12347 URA2YJL130C 6645 nt3.63□□□□□ -1.83
HRT3Q12347 RSF2YJR127C 4143 nt3.63□□□□□ -1.83
HRT3Q12347 BMH1YER177W 804 nt3.62□□□□□ -1.83
HRT3Q12347 COX2Q0250 756 nt3.62□□□□□ -1.83
HRT3Q12347 RSM26YJR101W 801 nt3.62□□□□□ -1.83
HRT3Q12347 YLR042CYLR042C 486 nt3.62□□□□□ -1.83
HRT3Q12347 YBL094CYBL094C 333 nt3.62□□□□□ -1.83
HRT3Q12347 YOR062CYOR062C 807 nt3.62□□□□□ -1.83
HRT3Q12347 YBR137WYBR137W 540 nt3.62□□□□□ -1.83
HRT3Q12347 NEM1YHR004C 1341 nt3.62□□□□□ -1.83
HRT3Q12347 TAF1YGR274C 3201 nt3.62□□□□□ -1.83
HRT3Q12347 FAA1YOR317W 2103 nt3.61□□□□□ -1.83
HRT3Q12347 GPI10YGL142C 1851 nt3.61□□□□□ -1.83
HRT3Q12347 GIC2YDR309C 1152 nt3.61□□□□□ -1.83
HRT3Q12347 LIP2YLR239C 987 nt3.61□□□□□ -1.83
HRT3Q12347 YLR365WYLR365W 333 nt3.61□□□□□ -1.83
HRT3Q12347 RPS10BYMR230W 318 nt3.61□□□□□ -1.83
HRT3Q12347 YOL107WYOL107W 1029 nt3.61□□□□□ -1.83
HRT3Q12347 TAZ1YPR140W 1146 nt3.61□□□□□ -1.83
HRT3Q12347 RNR1YER070W 2667 nt3.6□□□□□ -1.83
HRT3Q12347 RSC1YGR056W 2787 nt3.6□□□□□ -1.83
HRT3Q12347 PRP11YDL043C 801 nt3.6□□□□□ -1.83
HRT3Q12347 YGL214WYGL214W 486 nt3.6□□□□□ -1.83
HRT3Q12347 MRPS35YGR165W 1038 nt3.6□□□□□ -1.83
HRT3Q12347 tV(CAC)DtV(CAC)D 73 nt3.6□□□□□ -1.83
HRT3Q12347 tV(CAC)HtV(CAC)H 73 nt3.6□□□□□ -1.83
HRT3Q12347 HOT13YKL084W 351 nt3.6□□□□□ -1.83
HRT3Q12347 CPR3YML078W 549 nt3.6□□□□□ -1.83
HRT3Q12347 RPL19BYBL027W 570 nt3.6□□□□□ -1.83
HRT3Q12347 YNL303WYNL303W 348 nt3.6□□□□□ -1.83
HRT3Q12347 MDJ2YNL328C 441 nt3.6□□□□□ -1.83
HRT3Q12347 CPR8YNR028W 927 nt3.6□□□□□ -1.83
HRT3Q12347 WRS1YOL097C 1299 nt3.6□□□□□ -1.83
HRT3Q12347 THI80YOR143C 960 nt3.6□□□□□ -1.83
HRT3Q12347 SUT2YPR009W 807 nt3.6□□□□□ -1.83
HRT3Q12347 RAD2YGR258C 3096 nt3.6□□□□□ -1.83
HRT3Q12347 CDC9YDL164C 2268 nt3.6□□□□□ -1.83
HRT3Q12347 FBP26YJL155C 1359 nt3.6□□□□□ -1.83
HRT3Q12347 ALA1YOR335C 2877 nt3.6□□□□□ -1.83
HRT3Q12347 KIP3YGL216W 2418 nt3.6□□□□□ -1.83
HRT3Q12347 YCR024C-BYCR024C-B 267 nt3.59□□□□□ -1.83
HRT3Q12347 MSS2YDL107W 1056 nt3.59□□□□□ -1.83
HRT3Q12347 PHO13YDL236W 939 nt3.59□□□□□ -1.83
HRT3Q12347 PAU10YDR542W 363 nt3.59□□□□□ -1.83
HRT3Q12347 YGL188CYGL188C 174 nt3.59□□□□□ -1.83
HRT3Q12347 YGL218WYGL218W 651 nt3.59□□□□□ -1.83
HRT3Q12347 PAU11YGL261C 363 nt3.59□□□□□ -1.83
HRT3Q12347 ERG25YGR060W 930 nt3.59□□□□□ -1.83
HRT3Q12347 PAU13YHL046C 363 nt3.59□□□□□ -1.83
HRT3Q12347 POL32YJR043C 1053 nt3.59□□□□□ -1.83
HRT3Q12347 SWC7YLR385C 399 nt3.59□□□□□ -1.83
HRT3Q12347 PAU4YLR461W 363 nt3.59□□□□□ -1.83
HRT3Q12347 POP8YBL018C 402 nt3.59□□□□□ -1.83
HRT3Q12347 YML094C-AYML094C-A 402 nt3.59□□□□□ -1.83
HRT3Q12347 TPP1YMR156C 717 nt3.59□□□□□ -1.83
HRT3Q12347 MCK1YNL307C 1128 nt3.59□□□□□ -1.83
HRT3Q12347 AIM39YOL053W 1188 nt3.59□□□□□ -1.83
HRT3Q12347 YPR142CYPR142C 564 nt3.59□□□□□ -1.83
HRT3Q12347 TYR1YBR166C 1359 nt3.59□□□□□ -1.83
HRT3Q12347 AKR1YDR264C 2295 nt3.59□□□□□ -1.84
HRT3Q12347 SRS2YJL092W 3525 nt3.58□□□□□ -1.84
HRT3Q12347 YCR015CYCR015C 954 nt3.58□□□□□ -1.84
HRT3Q12347 SPO73YER046W 432 nt3.58□□□□□ -1.84
HRT3Q12347 YIR021W-AYIR021W-A 213 nt3.58□□□□□ -1.84
HRT3Q12347 YAE1YJR067C 426 nt3.58□□□□□ -1.84
HRT3Q12347 ECM4YKR076W 1113 nt3.58□□□□□ -1.84
HRT3Q12347 MTD1YKR080W 963 nt3.58□□□□□ -1.84
HRT3Q12347 IRC25YLR021W 540 nt3.58□□□□□ -1.84
HRT3Q12347 RIM11YMR139W 1113 nt3.58□□□□□ -1.84
HRT3Q12347 YBL062WYBL062W 381 nt3.58□□□□□ -1.84
HRT3Q12347 PEX27YOR193W 1131 nt3.58□□□□□ -1.84
HRT3Q12347 PNT1YOR266W 1272 nt3.58□□□□□ -1.84
HRT3Q12347 TAF3YPL011C 1062 nt3.58□□□□□ -1.84
HRT3Q12347 snR37snR37 386 nt3.58□□□□□ -1.84
HRT3Q12347 RPS9BYBR189W 588 nt3.58□□□□□ -1.84
HRT3Q12347 YDR034C-CYDR034C-C 1317 nt3.58□□□□□ -1.84
HRT3Q12347 YLR410W-AYLR410W-A 1317 nt3.58□□□□□ -1.84
HRT3Q12347 CIT1YNR001C 1440 nt3.58□□□□□ -1.84
HRT3Q12347 TRM13YOL125W 1431 nt3.58□□□□□ -1.84
HRT3Q12347 RIM4YHL024W 2142 nt3.58□□□□□ -1.84
HRT3Q12347 MTR4YJL050W 3222 nt3.57□□□□□ -1.84
HRT3Q12347 YCR050CYCR050C 309 nt3.57□□□□□ -1.84
HRT3Q12347 YCR100CYCR100C 951 nt3.57□□□□□ -1.84
HRT3Q12347 OPI6YDL096C 327 nt3.57□□□□□ -1.84
HRT3Q12347 XRS2YDR369C 2565 nt3.57□□□□□ -1.84
HRT3Q12347 YGR149WYGR149W 1299 nt3.57□□□□□ -1.84
HRT3Q12347 YHL026CYHL026C 948 nt3.57□□□□□ -1.84
HRT3Q12347 ECM34YHL043W 513 nt3.57□□□□□ -1.84
HRT3Q12347 SHQ1YIL104C 1524 nt3.57□□□□□ -1.84
HRT3Q12347 YNR063WYNR063W 1824 nt3.57□□□□□ -1.84
HRT3Q12347 YOL118CYOL118C 309 nt3.57□□□□□ -1.84
HRT3Q12347 YPR108W-AYPR108W-A 213 nt3.57□□□□□ -1.84
HRT3Q12347 MRPS9YBR146W 837 nt3.57□□□□□ -1.84
HRT3Q12347 CNS1YBR155W 1158 nt3.57□□□□□ -1.84
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 23.1 ms