Protein–RNA interactions for Protein: Q12266

TY1A-BL, Transposon Ty1-BL Gag polyprotein, yeastyeast

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Length 440 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
TY1A-BLQ12266 YMR310CYMR310C 954 nt5.65□□□□□ -1.5
TY1A-BLQ12266 RUF23RUF23 254 nt5.65□□□□□ -1.5
TY1A-BLQ12266 ENP2YGR145W 2124 nt5.65□□□□□ -1.51
TY1A-BLQ12266 CLB1YGR108W 1416 nt5.65□□□□□ -1.51
TY1A-BLQ12266 CNE1YAL058W 1509 nt5.64□□□□□ -1.51
TY1A-BLQ12266 EFT2YDR385W 2529 nt5.64□□□□□ -1.51
TY1A-BLQ12266 EFT1YOR133W 2529 nt5.64□□□□□ -1.51
TY1A-BLQ12266 YDL007C-AYDL007C-A 258 nt5.64□□□□□ -1.51
TY1A-BLQ12266 YDL085C-AYDL085C-A 207 nt5.64□□□□□ -1.51
TY1A-BLQ12266 YDR417CYDR417C 372 nt5.64□□□□□ -1.51
TY1A-BLQ12266 SEC13YLR208W 894 nt5.64□□□□□ -1.51
TY1A-BLQ12266 YMR046W-AYMR046W-A 129 nt5.64□□□□□ -1.51
TY1A-BLQ12266 HCH1YNL281W 462 nt5.64□□□□□ -1.51
TY1A-BLQ12266 YOR379CYOR379C 339 nt5.64□□□□□ -1.51
TY1A-BLQ12266 SSL1YLR005W 1386 nt5.64□□□□□ -1.51
TY1A-BLQ12266 THP1YOL072W 1368 nt5.64□□□□□ -1.51
TY1A-BLQ12266 CSC1YLR241W 2349 nt5.64□□□□□ -1.51
TY1A-BLQ12266 THR4YCR053W 1545 nt5.64□□□□□ -1.51
TY1A-BLQ12266 CGR1YGL029W 363 nt5.63□□□□□ -1.51
TY1A-BLQ12266 CDC43YGL155W 1131 nt5.63□□□□□ -1.51
TY1A-BLQ12266 OTU2YHL013C 924 nt5.63□□□□□ -1.51
TY1A-BLQ12266 COA1YIL157C 594 nt5.63□□□□□ -1.51
TY1A-BLQ12266 ASK1YKL052C 879 nt5.63□□□□□ -1.51
TY1A-BLQ12266 MOH1YBL049W 417 nt5.63□□□□□ -1.51
TY1A-BLQ12266 OCA2YNL056W 594 nt5.63□□□□□ -1.51
TY1A-BLQ12266 YPT53YNL093W 663 nt5.63□□□□□ -1.51
TY1A-BLQ12266 YBR056W-AYBR056W-A 201 nt5.63□□□□□ -1.51
TY1A-BLQ12266 TAE1YBR261C 699 nt5.63□□□□□ -1.51
TY1A-BLQ12266 YJR098CYJR098C 1971 nt5.63□□□□□ -1.51
TY1A-BLQ12266 FMP30YPL103C 1407 nt5.63□□□□□ -1.51
TY1A-BLQ12266 SAT4YCR008W 1812 nt5.62□□□□□ -1.51
TY1A-BLQ12266 MSA1YOR066W 1890 nt5.62□□□□□ -1.51
TY1A-BLQ12266 MAK5YBR142W 2322 nt5.62□□□□□ -1.51
TY1A-BLQ12266 YDR406W-AYDR406W-A 246 nt5.62□□□□□ -1.51
TY1A-BLQ12266 RGI1YER067W 486 nt5.62□□□□□ -1.51
TY1A-BLQ12266 MRPL9YGR220C 810 nt5.62□□□□□ -1.51
TY1A-BLQ12266 BNA1YJR025C 534 nt5.62□□□□□ -1.51
TY1A-BLQ12266 MEH1YKR007W 555 nt5.62□□□□□ -1.51
TY1A-BLQ12266 ZRT2YLR130C 1269 nt5.62□□□□□ -1.51
TY1A-BLQ12266 BSC3YLR465C 309 nt5.62□□□□□ -1.51
TY1A-BLQ12266 RPL13BYMR142C 600 nt5.62□□□□□ -1.51
TY1A-BLQ12266 RPN7YPR108W 1290 nt5.62□□□□□ -1.51
TY1A-BLQ12266 FYV5YCL058C 459 nt5.62□□□□□ -1.51
TY1A-BLQ12266 PTC3YBL056W 1407 nt5.62□□□□□ -1.51
TY1A-BLQ12266 THI22YPR121W 1719 nt5.62□□□□□ -1.51
TY1A-BLQ12266 YHR218W-AYHR218W-A 318 nt5.61□□□□□ -1.51
TY1A-BLQ12266 AIM29YKR074W 468 nt5.61□□□□□ -1.51
TY1A-BLQ12266 RPS0BYLR048W 759 nt5.61□□□□□ -1.51
TY1A-BLQ12266 YLR050CYLR050C 486 nt5.61□□□□□ -1.51
TY1A-BLQ12266 HRP1YOL123W 1605 nt5.61□□□□□ -1.51
TY1A-BLQ12266 YBL112CYBL112C 318 nt5.61□□□□□ -1.51
TY1A-BLQ12266 YOR082CYOR082C 342 nt5.61□□□□□ -1.51
TY1A-BLQ12266 AFT2YPL202C 1251 nt5.61□□□□□ -1.51
TY1A-BLQ12266 SPN1YPR133C 1233 nt5.61□□□□□ -1.51
TY1A-BLQ12266 SGF29YCL010C 780 nt5.61□□□□□ -1.51
TY1A-BLQ12266 snR54snR54 86 nt5.61□□□□□ -1.51
TY1A-BLQ12266 SEO1YAL067C 1782 nt5.6□□□□□ -1.51
TY1A-BLQ12266 MKK1YOR231W 1527 nt5.6□□□□□ -1.51
TY1A-BLQ12266 snR80snR80 171 nt5.6□□□□□ -1.51
TY1A-BLQ12266 YDL144CYDL144C 1071 nt5.6□□□□□ -1.51
TY1A-BLQ12266 GAL83YER027C 1254 nt5.6□□□□□ -1.51
TY1A-BLQ12266 SLO1YER180C-A 258 nt5.6□□□□□ -1.51
TY1A-BLQ12266 POR2YIL114C 846 nt5.6□□□□□ -1.51
TY1A-BLQ12266 COX8YLR395C 237 nt5.6□□□□□ -1.51
TY1A-BLQ12266 SEC17YBL050W 879 nt5.6□□□□□ -1.51
TY1A-BLQ12266 YMR290W-AYMR290W-A 348 nt5.6□□□□□ -1.51
TY1A-BLQ12266 HEM4YOR278W 828 nt5.6□□□□□ -1.51
TY1A-BLQ12266 LDB19YOR322C 2457 nt5.6□□□□□ -1.51
TY1A-BLQ12266 STB5YHR178W 2232 nt5.6□□□□□ -1.51
TY1A-BLQ12266 XBP1YIL101C 1944 nt5.6□□□□□ -1.51
TY1A-BLQ12266 GUF1YLR289W 1938 nt5.6□□□□□ -1.51
TY1A-BLQ12266 AMD2YDR242W 1650 nt5.59□□□□□ -1.51
TY1A-BLQ12266 THI4YGR144W 981 nt5.59□□□□□ -1.51
TY1A-BLQ12266 YHR052W-AYHR052W-A 195 nt5.59□□□□□ -1.51
TY1A-BLQ12266 YHR054W-AYHR054W-A 195 nt5.59□□□□□ -1.51
TY1A-BLQ12266 REC104YHR157W 549 nt5.59□□□□□ -1.51
TY1A-BLQ12266 EFM4YIL064W 774 nt5.59□□□□□ -1.51
TY1A-BLQ12266 MDH1YKL085W 1005 nt5.59□□□□□ -1.51
TY1A-BLQ12266 UPS2YLR168C 693 nt5.59□□□□□ -1.51
TY1A-BLQ12266 SCW10YMR305C 1170 nt5.59□□□□□ -1.51
TY1A-BLQ12266 EOS1YNL080C 1101 nt5.59□□□□□ -1.51
TY1A-BLQ12266 YOR186WYOR186W 435 nt5.59□□□□□ -1.51
TY1A-BLQ12266 YPR170CYPR170C 336 nt5.59□□□□□ -1.51
TY1A-BLQ12266 HPA2YPR193C 471 nt5.59□□□□□ -1.51
TY1A-BLQ12266 YBR126W-AYBR126W-A 207 nt5.59□□□□□ -1.51
TY1A-BLQ12266 YHL017WYHL017W 1599 nt5.59□□□□□ -1.52
TY1A-BLQ12266 YDR444WYDR444W 2064 nt5.59□□□□□ -1.52
TY1A-BLQ12266 PRP3YDR473C 1410 nt5.58□□□□□ -1.52
TY1A-BLQ12266 HRQ1YDR291W 3234 nt5.58□□□□□ -1.52
TY1A-BLQ12266 SSF1YHR066W 1362 nt5.58□□□□□ -1.52
TY1A-BLQ12266 YEL077W-AYEL077W-A 483 nt5.58□□□□□ -1.52
TY1A-BLQ12266 YER190C-BYER190C-B 483 nt5.58□□□□□ -1.52
TY1A-BLQ12266 YFL068WYFL068W 483 nt5.58□□□□□ -1.52
TY1A-BLQ12266 YGR296C-BYGR296C-B 483 nt5.58□□□□□ -1.52
TY1A-BLQ12266 YHL050W-AYHL050W-A 483 nt5.58□□□□□ -1.52
TY1A-BLQ12266 YHR219C-AYHR219C-A 483 nt5.58□□□□□ -1.52
TY1A-BLQ12266 YLL066W-AYLL066W-A 483 nt5.58□□□□□ -1.52
TY1A-BLQ12266 YLL067W-AYLL067W-A 483 nt5.58□□□□□ -1.52
TY1A-BLQ12266 YLR466C-AYLR466C-A 483 nt5.58□□□□□ -1.52
TY1A-BLQ12266 YLR467C-AYLR467C-A 483 nt5.58□□□□□ -1.52
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