Protein–RNA interactions for Protein: Q0P6D6

CCDC15, Coiled-coil domain-containing protein 15, humanhuman

Predictions only

Length 951 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC15Q0P6D6 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC15Q0P6D6 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC15Q0P6D6 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC15Q0P6D6 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC15Q0P6D6 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC15Q0P6D6 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC15Q0P6D6 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC15Q0P6D6 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC15Q0P6D6 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC15Q0P6D6 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC15Q0P6D6 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC15Q0P6D6 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC15Q0P6D6 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC15Q0P6D6 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC15Q0P6D6 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC15Q0P6D6 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC15Q0P6D6 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC15Q0P6D6 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC15Q0P6D6 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC15Q0P6D6 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC15Q0P6D6 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC15Q0P6D6 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC15Q0P6D6 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC15Q0P6D6 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC15Q0P6D6 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC15Q0P6D6 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC15Q0P6D6 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC15Q0P6D6 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC15Q0P6D6 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC15Q0P6D6 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC15Q0P6D6 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC15Q0P6D6 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC15Q0P6D6 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC15Q0P6D6 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC15Q0P6D6 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC15Q0P6D6 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC15Q0P6D6 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.15
CCDC15Q0P6D6 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC15Q0P6D6 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC15Q0P6D6 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC15Q0P6D6 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC15Q0P6D6 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC15Q0P6D6 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC15Q0P6D6 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC15Q0P6D6 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC15Q0P6D6 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC15Q0P6D6 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC15Q0P6D6 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC15Q0P6D6 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC15Q0P6D6 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC15Q0P6D6 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC15Q0P6D6 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC15Q0P6D6 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC15Q0P6D6 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC15Q0P6D6 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC15Q0P6D6 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC15Q0P6D6 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC15Q0P6D6 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC15Q0P6D6 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC15Q0P6D6 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC15Q0P6D6 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC15Q0P6D6 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC15Q0P6D6 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC15Q0P6D6 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC15Q0P6D6 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC15Q0P6D6 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC15Q0P6D6 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC15Q0P6D6 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC15Q0P6D6 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC15Q0P6D6 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC15Q0P6D6 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC15Q0P6D6 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC15Q0P6D6 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC15Q0P6D6 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC15Q0P6D6 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC15Q0P6D6 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC15Q0P6D6 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC15Q0P6D6 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC15Q0P6D6 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC15Q0P6D6 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC15Q0P6D6 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC15Q0P6D6 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC15Q0P6D6 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC15Q0P6D6 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC15Q0P6D6 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC15Q0P6D6 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC15Q0P6D6 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC15Q0P6D6 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC15Q0P6D6 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC15Q0P6D6 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC15Q0P6D6 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC15Q0P6D6 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC15Q0P6D6 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC15Q0P6D6 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC15Q0P6D6 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC15Q0P6D6 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC15Q0P6D6 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC15Q0P6D6 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC15Q0P6D6 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC15Q0P6D6 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.6 ms