Protein–RNA interactions for Protein: Q08ER8

ZNF543, Zinc finger protein 543, humanhuman

Predictions only

Length 600 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF543Q08ER8 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ZNF543Q08ER8 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
ZNF543Q08ER8 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ZNF543Q08ER8 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC25.05■■□□□ 1.6
ZNF543Q08ER8 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ZNF543Q08ER8 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ZNF543Q08ER8 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
ZNF543Q08ER8 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ZNF543Q08ER8 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ZNF543Q08ER8 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
ZNF543Q08ER8 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ZNF543Q08ER8 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
ZNF543Q08ER8 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ZNF543Q08ER8 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
ZNF543Q08ER8 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC25.04■■□□□ 1.6
ZNF543Q08ER8 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
ZNF543Q08ER8 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
ZNF543Q08ER8 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
ZNF543Q08ER8 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
ZNF543Q08ER8 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
ZNF543Q08ER8 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
ZNF543Q08ER8 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
ZNF543Q08ER8 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
ZNF543Q08ER8 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
ZNF543Q08ER8 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ZNF543Q08ER8 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ZNF543Q08ER8 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
ZNF543Q08ER8 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ZNF543Q08ER8 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
ZNF543Q08ER8 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
ZNF543Q08ER8 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
ZNF543Q08ER8 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
ZNF543Q08ER8 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
ZNF543Q08ER8 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ZNF543Q08ER8 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
ZNF543Q08ER8 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ZNF543Q08ER8 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ZNF543Q08ER8 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ZNF543Q08ER8 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
ZNF543Q08ER8 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
ZNF543Q08ER8 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
ZNF543Q08ER8 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ZNF543Q08ER8 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ZNF543Q08ER8 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
ZNF543Q08ER8 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ZNF543Q08ER8 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
ZNF543Q08ER8 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
ZNF543Q08ER8 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ZNF543Q08ER8 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
ZNF543Q08ER8 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
ZNF543Q08ER8 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
ZNF543Q08ER8 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
ZNF543Q08ER8 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
ZNF543Q08ER8 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
ZNF543Q08ER8 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
ZNF543Q08ER8 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
ZNF543Q08ER8 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
ZNF543Q08ER8 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
ZNF543Q08ER8 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
ZNF543Q08ER8 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ZNF543Q08ER8 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
ZNF543Q08ER8 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
ZNF543Q08ER8 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
ZNF543Q08ER8 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ZNF543Q08ER8 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ZNF543Q08ER8 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ZNF543Q08ER8 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
ZNF543Q08ER8 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
ZNF543Q08ER8 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
ZNF543Q08ER8 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC25■■□□□ 1.59
ZNF543Q08ER8 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
ZNF543Q08ER8 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
ZNF543Q08ER8 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ZNF543Q08ER8 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ZNF543Q08ER8 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ZNF543Q08ER8 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ZNF543Q08ER8 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
ZNF543Q08ER8 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
ZNF543Q08ER8 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ZNF543Q08ER8 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
ZNF543Q08ER8 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
ZNF543Q08ER8 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
ZNF543Q08ER8 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
ZNF543Q08ER8 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
ZNF543Q08ER8 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
ZNF543Q08ER8 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
ZNF543Q08ER8 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
ZNF543Q08ER8 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
ZNF543Q08ER8 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
ZNF543Q08ER8 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
ZNF543Q08ER8 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
ZNF543Q08ER8 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ZNF543Q08ER8 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ZNF543Q08ER8 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ZNF543Q08ER8 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ZNF543Q08ER8 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ZNF543Q08ER8 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
ZNF543Q08ER8 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ZNF543Q08ER8 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
ZNF543Q08ER8 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms