Protein–RNA interactions for Protein: Q08AI8

C2orf54, Uncharacterized protein C2orf54, humanhuman

Predictions only

Length 447 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C2orf54Q08AI8 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
C2orf54Q08AI8 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
C2orf54Q08AI8 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
C2orf54Q08AI8 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
C2orf54Q08AI8 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
C2orf54Q08AI8 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
C2orf54Q08AI8 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
C2orf54Q08AI8 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
C2orf54Q08AI8 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
C2orf54Q08AI8 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
C2orf54Q08AI8 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
C2orf54Q08AI8 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
C2orf54Q08AI8 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
C2orf54Q08AI8 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
C2orf54Q08AI8 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
C2orf54Q08AI8 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
C2orf54Q08AI8 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
C2orf54Q08AI8 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
C2orf54Q08AI8 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
C2orf54Q08AI8 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
C2orf54Q08AI8 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
C2orf54Q08AI8 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
C2orf54Q08AI8 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
C2orf54Q08AI8 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
C2orf54Q08AI8 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
C2orf54Q08AI8 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
C2orf54Q08AI8 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
C2orf54Q08AI8 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
C2orf54Q08AI8 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
C2orf54Q08AI8 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
C2orf54Q08AI8 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
C2orf54Q08AI8 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
C2orf54Q08AI8 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
C2orf54Q08AI8 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
C2orf54Q08AI8 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
C2orf54Q08AI8 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
C2orf54Q08AI8 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
C2orf54Q08AI8 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
C2orf54Q08AI8 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
C2orf54Q08AI8 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
C2orf54Q08AI8 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
C2orf54Q08AI8 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
C2orf54Q08AI8 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
C2orf54Q08AI8 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
C2orf54Q08AI8 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
C2orf54Q08AI8 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
C2orf54Q08AI8 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
C2orf54Q08AI8 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
C2orf54Q08AI8 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
C2orf54Q08AI8 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
C2orf54Q08AI8 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
C2orf54Q08AI8 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
C2orf54Q08AI8 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
C2orf54Q08AI8 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
C2orf54Q08AI8 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
C2orf54Q08AI8 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
C2orf54Q08AI8 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
C2orf54Q08AI8 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
C2orf54Q08AI8 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
C2orf54Q08AI8 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
C2orf54Q08AI8 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
C2orf54Q08AI8 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
C2orf54Q08AI8 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
C2orf54Q08AI8 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
C2orf54Q08AI8 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
C2orf54Q08AI8 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
C2orf54Q08AI8 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC22.6■■□□□ 1.21
C2orf54Q08AI8 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
C2orf54Q08AI8 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
C2orf54Q08AI8 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
C2orf54Q08AI8 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
C2orf54Q08AI8 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
C2orf54Q08AI8 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
C2orf54Q08AI8 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
C2orf54Q08AI8 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
C2orf54Q08AI8 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
C2orf54Q08AI8 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
C2orf54Q08AI8 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
C2orf54Q08AI8 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
C2orf54Q08AI8 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
C2orf54Q08AI8 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
C2orf54Q08AI8 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
C2orf54Q08AI8 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
C2orf54Q08AI8 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
C2orf54Q08AI8 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
C2orf54Q08AI8 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
C2orf54Q08AI8 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
C2orf54Q08AI8 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
C2orf54Q08AI8 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
C2orf54Q08AI8 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
C2orf54Q08AI8 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
C2orf54Q08AI8 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
C2orf54Q08AI8 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
C2orf54Q08AI8 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
C2orf54Q08AI8 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
C2orf54Q08AI8 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
C2orf54Q08AI8 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
C2orf54Q08AI8 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
C2orf54Q08AI8 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
C2orf54Q08AI8 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.9 ms