Protein–RNA interactions for Protein: Q08999

RBL2, Retinoblastoma-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,139 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBL2Q08999 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
RBL2Q08999 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RBL2Q08999 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RBL2Q08999 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RBL2Q08999 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RBL2Q08999 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RBL2Q08999 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RBL2Q08999 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC24.55■■□□□ 1.52
RBL2Q08999 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RBL2Q08999 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
RBL2Q08999 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
RBL2Q08999 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RBL2Q08999 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
RBL2Q08999 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
RBL2Q08999 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
RBL2Q08999 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RBL2Q08999 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RBL2Q08999 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
RBL2Q08999 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RBL2Q08999 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RBL2Q08999 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
RBL2Q08999 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
RBL2Q08999 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
RBL2Q08999 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
RBL2Q08999 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RBL2Q08999 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
RBL2Q08999 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
RBL2Q08999 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
RBL2Q08999 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
RBL2Q08999 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
RBL2Q08999 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
RBL2Q08999 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RBL2Q08999 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
RBL2Q08999 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RBL2Q08999 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RBL2Q08999 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
RBL2Q08999 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
RBL2Q08999 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RBL2Q08999 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RBL2Q08999 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
RBL2Q08999 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RBL2Q08999 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RBL2Q08999 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RBL2Q08999 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
RBL2Q08999 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
RBL2Q08999 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RBL2Q08999 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
RBL2Q08999 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
RBL2Q08999 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
RBL2Q08999 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RBL2Q08999 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
RBL2Q08999 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
RBL2Q08999 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
RBL2Q08999 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
RBL2Q08999 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
RBL2Q08999 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RBL2Q08999 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
RBL2Q08999 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
RBL2Q08999 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
RBL2Q08999 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
RBL2Q08999 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
RBL2Q08999 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
RBL2Q08999 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RBL2Q08999 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
RBL2Q08999 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
RBL2Q08999 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC24.51■■□□□ 1.51
RBL2Q08999 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
RBL2Q08999 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RBL2Q08999 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RBL2Q08999 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
RBL2Q08999 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
RBL2Q08999 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
RBL2Q08999 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
RBL2Q08999 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RBL2Q08999 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RBL2Q08999 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
RBL2Q08999 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
RBL2Q08999 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RBL2Q08999 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RBL2Q08999 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
RBL2Q08999 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RBL2Q08999 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RBL2Q08999 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
RBL2Q08999 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RBL2Q08999 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RBL2Q08999 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RBL2Q08999 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
RBL2Q08999 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
RBL2Q08999 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
RBL2Q08999 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
RBL2Q08999 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
RBL2Q08999 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RBL2Q08999 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
RBL2Q08999 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
RBL2Q08999 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
RBL2Q08999 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
RBL2Q08999 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
RBL2Q08999 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
RBL2Q08999 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
RBL2Q08999 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.3 ms