Protein–RNA interactions for Protein: Q08499

PDE4D, cAMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase 4D, humanhuman

Predictions only

Length 809 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4DQ08499 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PDE4DQ08499 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PDE4DQ08499 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PDE4DQ08499 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PDE4DQ08499 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PDE4DQ08499 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PDE4DQ08499 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PDE4DQ08499 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.56
PDE4DQ08499 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
PDE4DQ08499 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
PDE4DQ08499 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
PDE4DQ08499 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
PDE4DQ08499 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
PDE4DQ08499 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PDE4DQ08499 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PDE4DQ08499 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PDE4DQ08499 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PDE4DQ08499 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PDE4DQ08499 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PDE4DQ08499 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PDE4DQ08499 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PDE4DQ08499 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PDE4DQ08499 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PDE4DQ08499 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
PDE4DQ08499 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PDE4DQ08499 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PDE4DQ08499 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PDE4DQ08499 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PDE4DQ08499 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PDE4DQ08499 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PDE4DQ08499 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PDE4DQ08499 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PDE4DQ08499 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PDE4DQ08499 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PDE4DQ08499 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PDE4DQ08499 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PDE4DQ08499 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PDE4DQ08499 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PDE4DQ08499 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PDE4DQ08499 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PDE4DQ08499 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PDE4DQ08499 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PDE4DQ08499 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PDE4DQ08499 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PDE4DQ08499 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PDE4DQ08499 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PDE4DQ08499 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PDE4DQ08499 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PDE4DQ08499 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PDE4DQ08499 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PDE4DQ08499 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PDE4DQ08499 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PDE4DQ08499 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PDE4DQ08499 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PDE4DQ08499 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PDE4DQ08499 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PDE4DQ08499 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PDE4DQ08499 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PDE4DQ08499 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PDE4DQ08499 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PDE4DQ08499 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PDE4DQ08499 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PDE4DQ08499 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PDE4DQ08499 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PDE4DQ08499 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
PDE4DQ08499 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PDE4DQ08499 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PDE4DQ08499 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PDE4DQ08499 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PDE4DQ08499 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PDE4DQ08499 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PDE4DQ08499 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PDE4DQ08499 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PDE4DQ08499 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PDE4DQ08499 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PDE4DQ08499 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PDE4DQ08499 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PDE4DQ08499 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PDE4DQ08499 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PDE4DQ08499 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PDE4DQ08499 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PDE4DQ08499 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PDE4DQ08499 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PDE4DQ08499 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PDE4DQ08499 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PDE4DQ08499 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PDE4DQ08499 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PDE4DQ08499 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PDE4DQ08499 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PDE4DQ08499 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PDE4DQ08499 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
PDE4DQ08499 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PDE4DQ08499 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PDE4DQ08499 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PDE4DQ08499 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PDE4DQ08499 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PDE4DQ08499 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PDE4DQ08499 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PDE4DQ08499 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PDE4DQ08499 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms