Protein–RNA interactions for Protein: Q08493

PDE4C, cAMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase 4C, humanhuman

Predictions only

Length 712 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4CQ08493 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PDE4CQ08493 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PDE4CQ08493 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PDE4CQ08493 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PDE4CQ08493 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PDE4CQ08493 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PDE4CQ08493 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PDE4CQ08493 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PDE4CQ08493 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PDE4CQ08493 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PDE4CQ08493 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PDE4CQ08493 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PDE4CQ08493 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PDE4CQ08493 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PDE4CQ08493 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PDE4CQ08493 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PDE4CQ08493 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PDE4CQ08493 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PDE4CQ08493 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PDE4CQ08493 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PDE4CQ08493 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
PDE4CQ08493 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PDE4CQ08493 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PDE4CQ08493 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PDE4CQ08493 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PDE4CQ08493 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PDE4CQ08493 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
PDE4CQ08493 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PDE4CQ08493 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PDE4CQ08493 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PDE4CQ08493 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PDE4CQ08493 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
PDE4CQ08493 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.36
PDE4CQ08493 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
PDE4CQ08493 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PDE4CQ08493 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PDE4CQ08493 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PDE4CQ08493 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PDE4CQ08493 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PDE4CQ08493 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PDE4CQ08493 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PDE4CQ08493 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PDE4CQ08493 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PDE4CQ08493 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PDE4CQ08493 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PDE4CQ08493 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PDE4CQ08493 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PDE4CQ08493 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PDE4CQ08493 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PDE4CQ08493 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PDE4CQ08493 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
PDE4CQ08493 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PDE4CQ08493 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PDE4CQ08493 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PDE4CQ08493 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PDE4CQ08493 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PDE4CQ08493 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PDE4CQ08493 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PDE4CQ08493 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PDE4CQ08493 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PDE4CQ08493 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PDE4CQ08493 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PDE4CQ08493 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PDE4CQ08493 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PDE4CQ08493 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PDE4CQ08493 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
PDE4CQ08493 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PDE4CQ08493 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PDE4CQ08493 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PDE4CQ08493 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PDE4CQ08493 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PDE4CQ08493 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
PDE4CQ08493 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PDE4CQ08493 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
PDE4CQ08493 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PDE4CQ08493 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PDE4CQ08493 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
PDE4CQ08493 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PDE4CQ08493 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PDE4CQ08493 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PDE4CQ08493 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PDE4CQ08493 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PDE4CQ08493 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PDE4CQ08493 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PDE4CQ08493 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PDE4CQ08493 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PDE4CQ08493 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PDE4CQ08493 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PDE4CQ08493 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PDE4CQ08493 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
PDE4CQ08493 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PDE4CQ08493 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PDE4CQ08493 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
PDE4CQ08493 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
PDE4CQ08493 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
PDE4CQ08493 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
PDE4CQ08493 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
PDE4CQ08493 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
PDE4CQ08493 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PDE4CQ08493 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.2 ms