Protein–RNA interactions for Protein: Q07654

TFF3, Trefoil factor 3, humanhuman

Predictions only

Length 80 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TFF3Q07654 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TFF3Q07654 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
TFF3Q07654 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
TFF3Q07654 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
TFF3Q07654 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
TFF3Q07654 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TFF3Q07654 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
TFF3Q07654 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
TFF3Q07654 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
TFF3Q07654 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
TFF3Q07654 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
TFF3Q07654 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
TFF3Q07654 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
TFF3Q07654 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
TFF3Q07654 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
TFF3Q07654 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
TFF3Q07654 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.64
TFF3Q07654 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
TFF3Q07654 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TFF3Q07654 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
TFF3Q07654 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
TFF3Q07654 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TFF3Q07654 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TFF3Q07654 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TFF3Q07654 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TFF3Q07654 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
TFF3Q07654 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
TFF3Q07654 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
TFF3Q07654 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC19.01■□□□□ 0.63
TFF3Q07654 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
TFF3Q07654 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
TFF3Q07654 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
TFF3Q07654 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
TFF3Q07654 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TFF3Q07654 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TFF3Q07654 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
TFF3Q07654 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
TFF3Q07654 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TFF3Q07654 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TFF3Q07654 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TFF3Q07654 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
TFF3Q07654 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TFF3Q07654 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
TFF3Q07654 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC19■□□□□ 0.63
TFF3Q07654 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC19■□□□□ 0.63
TFF3Q07654 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
TFF3Q07654 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TFF3Q07654 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
TFF3Q07654 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TFF3Q07654 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
TFF3Q07654 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
TFF3Q07654 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
TFF3Q07654 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
TFF3Q07654 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TFF3Q07654 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
TFF3Q07654 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
TFF3Q07654 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TFF3Q07654 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
TFF3Q07654 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TFF3Q07654 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TFF3Q07654 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TFF3Q07654 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
TFF3Q07654 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TFF3Q07654 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TFF3Q07654 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TFF3Q07654 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TFF3Q07654 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TFF3Q07654 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TFF3Q07654 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TFF3Q07654 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TFF3Q07654 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TFF3Q07654 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TFF3Q07654 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TFF3Q07654 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TFF3Q07654 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TFF3Q07654 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TFF3Q07654 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
TFF3Q07654 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TFF3Q07654 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
TFF3Q07654 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TFF3Q07654 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
TFF3Q07654 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
TFF3Q07654 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TFF3Q07654 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
TFF3Q07654 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
TFF3Q07654 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
TFF3Q07654 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC18.97■□□□□ 0.63
TFF3Q07654 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
TFF3Q07654 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TFF3Q07654 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TFF3Q07654 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TFF3Q07654 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TFF3Q07654 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TFF3Q07654 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
TFF3Q07654 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TFF3Q07654 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TFF3Q07654 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
TFF3Q07654 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TFF3Q07654 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TFF3Q07654 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms