Protein–RNA interactions for Protein: Q02487

DSC2, Desmocollin-2, humanhuman

Predictions only

Length 901 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSC2Q02487 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
DSC2Q02487 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
DSC2Q02487 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC21.94■■□□□ 1.1
DSC2Q02487 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
DSC2Q02487 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
DSC2Q02487 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
DSC2Q02487 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
DSC2Q02487 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
DSC2Q02487 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
DSC2Q02487 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
DSC2Q02487 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
DSC2Q02487 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
DSC2Q02487 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
DSC2Q02487 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
DSC2Q02487 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
DSC2Q02487 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
DSC2Q02487 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
DSC2Q02487 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
DSC2Q02487 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
DSC2Q02487 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
DSC2Q02487 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
DSC2Q02487 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
DSC2Q02487 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
DSC2Q02487 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
DSC2Q02487 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
DSC2Q02487 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
DSC2Q02487 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
DSC2Q02487 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
DSC2Q02487 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
DSC2Q02487 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
DSC2Q02487 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
DSC2Q02487 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
DSC2Q02487 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
DSC2Q02487 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
DSC2Q02487 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
DSC2Q02487 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
DSC2Q02487 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
DSC2Q02487 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
DSC2Q02487 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
DSC2Q02487 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
DSC2Q02487 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
DSC2Q02487 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
DSC2Q02487 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
DSC2Q02487 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
DSC2Q02487 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
DSC2Q02487 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
DSC2Q02487 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
DSC2Q02487 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
DSC2Q02487 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
DSC2Q02487 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
DSC2Q02487 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
DSC2Q02487 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
DSC2Q02487 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
DSC2Q02487 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
DSC2Q02487 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
DSC2Q02487 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
DSC2Q02487 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
DSC2Q02487 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
DSC2Q02487 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
DSC2Q02487 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
DSC2Q02487 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
DSC2Q02487 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
DSC2Q02487 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
DSC2Q02487 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
DSC2Q02487 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
DSC2Q02487 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
DSC2Q02487 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
DSC2Q02487 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
DSC2Q02487 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
DSC2Q02487 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
DSC2Q02487 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
DSC2Q02487 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
DSC2Q02487 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
DSC2Q02487 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
DSC2Q02487 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
DSC2Q02487 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
DSC2Q02487 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
DSC2Q02487 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
DSC2Q02487 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
DSC2Q02487 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
DSC2Q02487 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
DSC2Q02487 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
DSC2Q02487 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
DSC2Q02487 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
DSC2Q02487 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
DSC2Q02487 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
DSC2Q02487 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
DSC2Q02487 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
DSC2Q02487 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
DSC2Q02487 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
DSC2Q02487 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
DSC2Q02487 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
DSC2Q02487 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
DSC2Q02487 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
DSC2Q02487 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
DSC2Q02487 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
DSC2Q02487 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
DSC2Q02487 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
DSC2Q02487 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
DSC2Q02487 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.5 ms