Protein–RNA interactions for Protein: Q02246

CNTN2, Contactin-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,040 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTN2Q02246 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CNTN2Q02246 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
CNTN2Q02246 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
CNTN2Q02246 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CNTN2Q02246 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CNTN2Q02246 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CNTN2Q02246 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CNTN2Q02246 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CNTN2Q02246 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CNTN2Q02246 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CNTN2Q02246 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CNTN2Q02246 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CNTN2Q02246 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CNTN2Q02246 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CNTN2Q02246 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CNTN2Q02246 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CNTN2Q02246 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CNTN2Q02246 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CNTN2Q02246 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CNTN2Q02246 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CNTN2Q02246 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CNTN2Q02246 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
CNTN2Q02246 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CNTN2Q02246 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CNTN2Q02246 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CNTN2Q02246 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CNTN2Q02246 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CNTN2Q02246 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CNTN2Q02246 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CNTN2Q02246 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CNTN2Q02246 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CNTN2Q02246 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CNTN2Q02246 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CNTN2Q02246 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CNTN2Q02246 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CNTN2Q02246 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CNTN2Q02246 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
CNTN2Q02246 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CNTN2Q02246 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
CNTN2Q02246 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CNTN2Q02246 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CNTN2Q02246 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CNTN2Q02246 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
CNTN2Q02246 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CNTN2Q02246 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CNTN2Q02246 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CNTN2Q02246 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CNTN2Q02246 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CNTN2Q02246 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
CNTN2Q02246 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
CNTN2Q02246 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CNTN2Q02246 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CNTN2Q02246 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CNTN2Q02246 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
CNTN2Q02246 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CNTN2Q02246 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
CNTN2Q02246 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
CNTN2Q02246 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CNTN2Q02246 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CNTN2Q02246 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CNTN2Q02246 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CNTN2Q02246 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CNTN2Q02246 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CNTN2Q02246 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CNTN2Q02246 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CNTN2Q02246 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CNTN2Q02246 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CNTN2Q02246 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CNTN2Q02246 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CNTN2Q02246 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CNTN2Q02246 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CNTN2Q02246 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CNTN2Q02246 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CNTN2Q02246 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CNTN2Q02246 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CNTN2Q02246 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CNTN2Q02246 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CNTN2Q02246 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CNTN2Q02246 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CNTN2Q02246 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CNTN2Q02246 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
CNTN2Q02246 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CNTN2Q02246 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CNTN2Q02246 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CNTN2Q02246 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CNTN2Q02246 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CNTN2Q02246 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CNTN2Q02246 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CNTN2Q02246 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
CNTN2Q02246 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CNTN2Q02246 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CNTN2Q02246 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CNTN2Q02246 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
CNTN2Q02246 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CNTN2Q02246 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CNTN2Q02246 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CNTN2Q02246 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
CNTN2Q02246 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CNTN2Q02246 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CNTN2Q02246 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.6 ms