Protein–RNA interactions for Protein: Q02086

SP2, Transcription factor Sp2, humanhuman

Predictions only

Length 613 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SP2Q02086 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SP2Q02086 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SP2Q02086 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SP2Q02086 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SP2Q02086 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SP2Q02086 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SP2Q02086 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SP2Q02086 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SP2Q02086 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SP2Q02086 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SP2Q02086 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SP2Q02086 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SP2Q02086 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SP2Q02086 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SP2Q02086 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SP2Q02086 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SP2Q02086 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SP2Q02086 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SP2Q02086 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SP2Q02086 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SP2Q02086 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SP2Q02086 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SP2Q02086 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SP2Q02086 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SP2Q02086 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SP2Q02086 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SP2Q02086 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SP2Q02086 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SP2Q02086 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SP2Q02086 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SP2Q02086 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SP2Q02086 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
SP2Q02086 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SP2Q02086 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SP2Q02086 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SP2Q02086 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SP2Q02086 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
SP2Q02086 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SP2Q02086 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SP2Q02086 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SP2Q02086 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
SP2Q02086 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SP2Q02086 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SP2Q02086 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SP2Q02086 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SP2Q02086 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SP2Q02086 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SP2Q02086 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SP2Q02086 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
SP2Q02086 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SP2Q02086 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SP2Q02086 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SP2Q02086 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SP2Q02086 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SP2Q02086 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SP2Q02086 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
SP2Q02086 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SP2Q02086 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SP2Q02086 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SP2Q02086 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SP2Q02086 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
SP2Q02086 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SP2Q02086 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
SP2Q02086 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SP2Q02086 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SP2Q02086 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SP2Q02086 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SP2Q02086 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SP2Q02086 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SP2Q02086 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SP2Q02086 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SP2Q02086 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SP2Q02086 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SP2Q02086 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SP2Q02086 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SP2Q02086 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SP2Q02086 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SP2Q02086 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SP2Q02086 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SP2Q02086 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SP2Q02086 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SP2Q02086 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
SP2Q02086 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SP2Q02086 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SP2Q02086 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SP2Q02086 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SP2Q02086 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SP2Q02086 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SP2Q02086 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SP2Q02086 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SP2Q02086 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SP2Q02086 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SP2Q02086 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SP2Q02086 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SP2Q02086 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SP2Q02086 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SP2Q02086 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SP2Q02086 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SP2Q02086 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SP2Q02086 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.1 ms