Protein–RNA interactions for Protein: Q01726

MC1R, Melanocyte-stimulating hormone receptor, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MC1RQ01726 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC20.92■□□□□ 0.94
MC1RQ01726 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
MC1RQ01726 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
MC1RQ01726 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
MC1RQ01726 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
MC1RQ01726 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
MC1RQ01726 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
MC1RQ01726 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
MC1RQ01726 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
MC1RQ01726 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
MC1RQ01726 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
MC1RQ01726 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
MC1RQ01726 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
MC1RQ01726 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
MC1RQ01726 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
MC1RQ01726 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
MC1RQ01726 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
MC1RQ01726 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
MC1RQ01726 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
MC1RQ01726 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
MC1RQ01726 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
MC1RQ01726 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
MC1RQ01726 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC20.91■□□□□ 0.94
MC1RQ01726 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
MC1RQ01726 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
MC1RQ01726 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
MC1RQ01726 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
MC1RQ01726 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
MC1RQ01726 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
MC1RQ01726 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
MC1RQ01726 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
MC1RQ01726 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
MC1RQ01726 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
MC1RQ01726 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
MC1RQ01726 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
MC1RQ01726 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
MC1RQ01726 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
MC1RQ01726 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
MC1RQ01726 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
MC1RQ01726 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
MC1RQ01726 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
MC1RQ01726 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
MC1RQ01726 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
MC1RQ01726 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
MC1RQ01726 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
MC1RQ01726 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
MC1RQ01726 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
MC1RQ01726 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
MC1RQ01726 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
MC1RQ01726 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
MC1RQ01726 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
MC1RQ01726 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
MC1RQ01726 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
MC1RQ01726 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
MC1RQ01726 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
MC1RQ01726 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
MC1RQ01726 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
MC1RQ01726 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.94
MC1RQ01726 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
MC1RQ01726 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.94
MC1RQ01726 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.94
MC1RQ01726 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
MC1RQ01726 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
MC1RQ01726 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
MC1RQ01726 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
MC1RQ01726 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
MC1RQ01726 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
MC1RQ01726 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
MC1RQ01726 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC20.89■□□□□ 0.93
MC1RQ01726 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
MC1RQ01726 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
MC1RQ01726 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
MC1RQ01726 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
MC1RQ01726 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
MC1RQ01726 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
MC1RQ01726 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
MC1RQ01726 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC20.88■□□□□ 0.93
MC1RQ01726 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
MC1RQ01726 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
MC1RQ01726 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
MC1RQ01726 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
MC1RQ01726 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
MC1RQ01726 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
MC1RQ01726 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
MC1RQ01726 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
MC1RQ01726 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
MC1RQ01726 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
MC1RQ01726 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
MC1RQ01726 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
MC1RQ01726 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
MC1RQ01726 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
MC1RQ01726 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
MC1RQ01726 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
MC1RQ01726 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
MC1RQ01726 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
MC1RQ01726 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
MC1RQ01726 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
MC1RQ01726 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
MC1RQ01726 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
MC1RQ01726 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.8 ms