Protein–RNA interactions for Protein: Q01082

SPTBN1, Spectrin beta chain, non-erythrocytic 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTBN1Q01082 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SPTBN1Q01082 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SPTBN1Q01082 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SPTBN1Q01082 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SPTBN1Q01082 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SPTBN1Q01082 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SPTBN1Q01082 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
SPTBN1Q01082 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
SPTBN1Q01082 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SPTBN1Q01082 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SPTBN1Q01082 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SPTBN1Q01082 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SPTBN1Q01082 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SPTBN1Q01082 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SPTBN1Q01082 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SPTBN1Q01082 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SPTBN1Q01082 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SPTBN1Q01082 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SPTBN1Q01082 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SPTBN1Q01082 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SPTBN1Q01082 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SPTBN1Q01082 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SPTBN1Q01082 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SPTBN1Q01082 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
SPTBN1Q01082 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
SPTBN1Q01082 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.66
SPTBN1Q01082 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SPTBN1Q01082 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
SPTBN1Q01082 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SPTBN1Q01082 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SPTBN1Q01082 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SPTBN1Q01082 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SPTBN1Q01082 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SPTBN1Q01082 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SPTBN1Q01082 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SPTBN1Q01082 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SPTBN1Q01082 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SPTBN1Q01082 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SPTBN1Q01082 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SPTBN1Q01082 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SPTBN1Q01082 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SPTBN1Q01082 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SPTBN1Q01082 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SPTBN1Q01082 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SPTBN1Q01082 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SPTBN1Q01082 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SPTBN1Q01082 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SPTBN1Q01082 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SPTBN1Q01082 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
SPTBN1Q01082 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SPTBN1Q01082 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SPTBN1Q01082 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
SPTBN1Q01082 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SPTBN1Q01082 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SPTBN1Q01082 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SPTBN1Q01082 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SPTBN1Q01082 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SPTBN1Q01082 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SPTBN1Q01082 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SPTBN1Q01082 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SPTBN1Q01082 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
SPTBN1Q01082 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SPTBN1Q01082 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SPTBN1Q01082 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SPTBN1Q01082 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SPTBN1Q01082 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SPTBN1Q01082 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SPTBN1Q01082 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SPTBN1Q01082 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SPTBN1Q01082 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SPTBN1Q01082 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SPTBN1Q01082 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SPTBN1Q01082 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SPTBN1Q01082 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SPTBN1Q01082 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SPTBN1Q01082 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SPTBN1Q01082 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SPTBN1Q01082 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SPTBN1Q01082 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SPTBN1Q01082 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
SPTBN1Q01082 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SPTBN1Q01082 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SPTBN1Q01082 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SPTBN1Q01082 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SPTBN1Q01082 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SPTBN1Q01082 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SPTBN1Q01082 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
SPTBN1Q01082 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SPTBN1Q01082 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SPTBN1Q01082 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SPTBN1Q01082 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SPTBN1Q01082 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SPTBN1Q01082 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SPTBN1Q01082 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SPTBN1Q01082 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SPTBN1Q01082 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SPTBN1Q01082 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SPTBN1Q01082 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
SPTBN1Q01082 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SPTBN1Q01082 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.4 ms