Protein–RNA interactions for Protein: Q00994

BEX3, Protein BEX3, humanhuman

Predictions only

Length 111 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BEX3Q00994 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
BEX3Q00994 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
BEX3Q00994 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
BEX3Q00994 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
BEX3Q00994 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
BEX3Q00994 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
BEX3Q00994 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
BEX3Q00994 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
BEX3Q00994 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
BEX3Q00994 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
BEX3Q00994 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
BEX3Q00994 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
BEX3Q00994 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
BEX3Q00994 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
BEX3Q00994 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
BEX3Q00994 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
BEX3Q00994 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
BEX3Q00994 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
BEX3Q00994 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
BEX3Q00994 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
BEX3Q00994 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
BEX3Q00994 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
BEX3Q00994 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
BEX3Q00994 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
BEX3Q00994 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
BEX3Q00994 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
BEX3Q00994 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
BEX3Q00994 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
BEX3Q00994 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
BEX3Q00994 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
BEX3Q00994 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
BEX3Q00994 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
BEX3Q00994 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
BEX3Q00994 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
BEX3Q00994 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
BEX3Q00994 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
BEX3Q00994 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
BEX3Q00994 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
BEX3Q00994 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC24.15■■□□□ 1.46
BEX3Q00994 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.15■■□□□ 1.46
BEX3Q00994 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
BEX3Q00994 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
BEX3Q00994 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
BEX3Q00994 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
BEX3Q00994 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
BEX3Q00994 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
BEX3Q00994 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
BEX3Q00994 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
BEX3Q00994 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
BEX3Q00994 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
BEX3Q00994 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
BEX3Q00994 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
BEX3Q00994 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
BEX3Q00994 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
BEX3Q00994 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
BEX3Q00994 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
BEX3Q00994 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
BEX3Q00994 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
BEX3Q00994 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
BEX3Q00994 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
BEX3Q00994 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
BEX3Q00994 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
BEX3Q00994 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
BEX3Q00994 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
BEX3Q00994 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
BEX3Q00994 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
BEX3Q00994 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
BEX3Q00994 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
BEX3Q00994 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
BEX3Q00994 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
BEX3Q00994 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
BEX3Q00994 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
BEX3Q00994 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
BEX3Q00994 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
BEX3Q00994 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
BEX3Q00994 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
BEX3Q00994 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
BEX3Q00994 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
BEX3Q00994 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC24.11■■□□□ 1.45
BEX3Q00994 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
BEX3Q00994 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
BEX3Q00994 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
BEX3Q00994 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
BEX3Q00994 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
BEX3Q00994 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
BEX3Q00994 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
BEX3Q00994 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
BEX3Q00994 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
BEX3Q00994 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
BEX3Q00994 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
BEX3Q00994 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
BEX3Q00994 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
BEX3Q00994 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
BEX3Q00994 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
BEX3Q00994 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
BEX3Q00994 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
BEX3Q00994 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
BEX3Q00994 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
BEX3Q00994 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
BEX3Q00994 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms