Protein–RNA interactions for Protein: Q00587

CDC42EP1, Cdc42 effector protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC42EP1Q00587 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CDC42EP1Q00587 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CDC42EP1Q00587 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CDC42EP1Q00587 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CDC42EP1Q00587 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CDC42EP1Q00587 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CDC42EP1Q00587 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CDC42EP1Q00587 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CDC42EP1Q00587 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CDC42EP1Q00587 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CDC42EP1Q00587 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CDC42EP1Q00587 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CDC42EP1Q00587 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
CDC42EP1Q00587 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CDC42EP1Q00587 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CDC42EP1Q00587 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CDC42EP1Q00587 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CDC42EP1Q00587 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CDC42EP1Q00587 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CDC42EP1Q00587 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CDC42EP1Q00587 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CDC42EP1Q00587 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CDC42EP1Q00587 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CDC42EP1Q00587 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
CDC42EP1Q00587 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CDC42EP1Q00587 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CDC42EP1Q00587 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CDC42EP1Q00587 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CDC42EP1Q00587 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC23.64■■□□□ 1.38
CDC42EP1Q00587 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CDC42EP1Q00587 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CDC42EP1Q00587 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CDC42EP1Q00587 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CDC42EP1Q00587 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CDC42EP1Q00587 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CDC42EP1Q00587 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CDC42EP1Q00587 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CDC42EP1Q00587 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CDC42EP1Q00587 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CDC42EP1Q00587 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
CDC42EP1Q00587 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CDC42EP1Q00587 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CDC42EP1Q00587 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
CDC42EP1Q00587 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CDC42EP1Q00587 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CDC42EP1Q00587 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CDC42EP1Q00587 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CDC42EP1Q00587 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CDC42EP1Q00587 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CDC42EP1Q00587 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CDC42EP1Q00587 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CDC42EP1Q00587 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CDC42EP1Q00587 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CDC42EP1Q00587 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CDC42EP1Q00587 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CDC42EP1Q00587 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CDC42EP1Q00587 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CDC42EP1Q00587 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CDC42EP1Q00587 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CDC42EP1Q00587 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CDC42EP1Q00587 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CDC42EP1Q00587 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CDC42EP1Q00587 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CDC42EP1Q00587 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CDC42EP1Q00587 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CDC42EP1Q00587 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CDC42EP1Q00587 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CDC42EP1Q00587 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CDC42EP1Q00587 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CDC42EP1Q00587 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CDC42EP1Q00587 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CDC42EP1Q00587 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CDC42EP1Q00587 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CDC42EP1Q00587 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CDC42EP1Q00587 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CDC42EP1Q00587 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CDC42EP1Q00587 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CDC42EP1Q00587 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CDC42EP1Q00587 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CDC42EP1Q00587 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CDC42EP1Q00587 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CDC42EP1Q00587 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CDC42EP1Q00587 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CDC42EP1Q00587 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CDC42EP1Q00587 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CDC42EP1Q00587 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CDC42EP1Q00587 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CDC42EP1Q00587 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CDC42EP1Q00587 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
CDC42EP1Q00587 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CDC42EP1Q00587 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CDC42EP1Q00587 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CDC42EP1Q00587 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CDC42EP1Q00587 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CDC42EP1Q00587 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CDC42EP1Q00587 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CDC42EP1Q00587 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CDC42EP1Q00587 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CDC42EP1Q00587 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CDC42EP1Q00587 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms