Protein–RNA interactions for Protein: Q00532

CDKL1, Cyclin-dependent kinase-like 1, humanhuman

Predictions only

Length 357 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKL1Q00532 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CDKL1Q00532 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CDKL1Q00532 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CDKL1Q00532 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CDKL1Q00532 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CDKL1Q00532 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CDKL1Q00532 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CDKL1Q00532 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CDKL1Q00532 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CDKL1Q00532 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CDKL1Q00532 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CDKL1Q00532 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CDKL1Q00532 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CDKL1Q00532 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CDKL1Q00532 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CDKL1Q00532 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CDKL1Q00532 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CDKL1Q00532 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CDKL1Q00532 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CDKL1Q00532 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CDKL1Q00532 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CDKL1Q00532 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CDKL1Q00532 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CDKL1Q00532 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CDKL1Q00532 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CDKL1Q00532 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CDKL1Q00532 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CDKL1Q00532 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CDKL1Q00532 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CDKL1Q00532 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CDKL1Q00532 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CDKL1Q00532 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CDKL1Q00532 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CDKL1Q00532 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CDKL1Q00532 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CDKL1Q00532 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CDKL1Q00532 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.99
CDKL1Q00532 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CDKL1Q00532 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CDKL1Q00532 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CDKL1Q00532 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CDKL1Q00532 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CDKL1Q00532 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CDKL1Q00532 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CDKL1Q00532 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CDKL1Q00532 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
CDKL1Q00532 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CDKL1Q00532 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CDKL1Q00532 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CDKL1Q00532 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CDKL1Q00532 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CDKL1Q00532 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
CDKL1Q00532 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CDKL1Q00532 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CDKL1Q00532 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CDKL1Q00532 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CDKL1Q00532 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CDKL1Q00532 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CDKL1Q00532 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CDKL1Q00532 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CDKL1Q00532 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CDKL1Q00532 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CDKL1Q00532 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CDKL1Q00532 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CDKL1Q00532 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CDKL1Q00532 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
CDKL1Q00532 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CDKL1Q00532 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CDKL1Q00532 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
CDKL1Q00532 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CDKL1Q00532 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CDKL1Q00532 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CDKL1Q00532 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CDKL1Q00532 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CDKL1Q00532 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CDKL1Q00532 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CDKL1Q00532 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CDKL1Q00532 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CDKL1Q00532 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CDKL1Q00532 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CDKL1Q00532 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CDKL1Q00532 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CDKL1Q00532 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CDKL1Q00532 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CDKL1Q00532 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CDKL1Q00532 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CDKL1Q00532 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CDKL1Q00532 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CDKL1Q00532 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CDKL1Q00532 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CDKL1Q00532 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CDKL1Q00532 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CDKL1Q00532 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
CDKL1Q00532 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CDKL1Q00532 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CDKL1Q00532 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CDKL1Q00532 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CDKL1Q00532 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CDKL1Q00532 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CDKL1Q00532 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms