Protein–RNA interactions for Protein: P78312

FAM193A, Protein FAM193A, humanhuman

Predictions only

Length 1,265 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM193AP78312 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
FAM193AP78312 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
FAM193AP78312 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
FAM193AP78312 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
FAM193AP78312 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
FAM193AP78312 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
FAM193AP78312 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
FAM193AP78312 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
FAM193AP78312 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
FAM193AP78312 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
FAM193AP78312 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
FAM193AP78312 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
FAM193AP78312 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
FAM193AP78312 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
FAM193AP78312 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
FAM193AP78312 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
FAM193AP78312 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
FAM193AP78312 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
FAM193AP78312 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
FAM193AP78312 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
FAM193AP78312 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
FAM193AP78312 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
FAM193AP78312 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
FAM193AP78312 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
FAM193AP78312 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
FAM193AP78312 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
FAM193AP78312 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
FAM193AP78312 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
FAM193AP78312 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
FAM193AP78312 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
FAM193AP78312 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
FAM193AP78312 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
FAM193AP78312 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
FAM193AP78312 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
FAM193AP78312 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
FAM193AP78312 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
FAM193AP78312 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
FAM193AP78312 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
FAM193AP78312 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
FAM193AP78312 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
FAM193AP78312 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
FAM193AP78312 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
FAM193AP78312 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
FAM193AP78312 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
FAM193AP78312 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
FAM193AP78312 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
FAM193AP78312 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
FAM193AP78312 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC23.22■■□□□ 1.31
FAM193AP78312 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
FAM193AP78312 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
FAM193AP78312 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
FAM193AP78312 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
FAM193AP78312 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
FAM193AP78312 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
FAM193AP78312 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
FAM193AP78312 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
FAM193AP78312 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
FAM193AP78312 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
FAM193AP78312 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
FAM193AP78312 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
FAM193AP78312 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
FAM193AP78312 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
FAM193AP78312 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
FAM193AP78312 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
FAM193AP78312 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC23.2■■□□□ 1.3
FAM193AP78312 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
FAM193AP78312 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
FAM193AP78312 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
FAM193AP78312 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
FAM193AP78312 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
FAM193AP78312 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
FAM193AP78312 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
FAM193AP78312 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
FAM193AP78312 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
FAM193AP78312 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
FAM193AP78312 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
FAM193AP78312 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
FAM193AP78312 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
FAM193AP78312 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
FAM193AP78312 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
FAM193AP78312 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
FAM193AP78312 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
FAM193AP78312 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
FAM193AP78312 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
FAM193AP78312 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
FAM193AP78312 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
FAM193AP78312 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
FAM193AP78312 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
FAM193AP78312 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
FAM193AP78312 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
FAM193AP78312 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
FAM193AP78312 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
FAM193AP78312 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
FAM193AP78312 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
FAM193AP78312 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
FAM193AP78312 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
FAM193AP78312 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
FAM193AP78312 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
FAM193AP78312 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
FAM193AP78312 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.6 ms