Protein–RNA interactions for Protein: P67936

TPM4, Tropomyosin alpha-4 chain, humanhuman

Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPM4P67936 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
TPM4P67936 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC24.14■■□□□ 1.45
TPM4P67936 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
TPM4P67936 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TPM4P67936 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TPM4P67936 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
TPM4P67936 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TPM4P67936 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TPM4P67936 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TPM4P67936 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TPM4P67936 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TPM4P67936 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TPM4P67936 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TPM4P67936 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TPM4P67936 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TPM4P67936 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TPM4P67936 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TPM4P67936 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TPM4P67936 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TPM4P67936 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TPM4P67936 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TPM4P67936 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TPM4P67936 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TPM4P67936 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TPM4P67936 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TPM4P67936 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TPM4P67936 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TPM4P67936 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TPM4P67936 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TPM4P67936 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TPM4P67936 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TPM4P67936 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TPM4P67936 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TPM4P67936 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TPM4P67936 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TPM4P67936 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
TPM4P67936 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TPM4P67936 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TPM4P67936 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TPM4P67936 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TPM4P67936 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TPM4P67936 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TPM4P67936 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TPM4P67936 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TPM4P67936 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TPM4P67936 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TPM4P67936 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TPM4P67936 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TPM4P67936 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TPM4P67936 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TPM4P67936 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TPM4P67936 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TPM4P67936 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TPM4P67936 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TPM4P67936 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TPM4P67936 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TPM4P67936 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TPM4P67936 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TPM4P67936 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TPM4P67936 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TPM4P67936 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TPM4P67936 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TPM4P67936 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TPM4P67936 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TPM4P67936 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TPM4P67936 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TPM4P67936 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TPM4P67936 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
TPM4P67936 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TPM4P67936 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TPM4P67936 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TPM4P67936 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TPM4P67936 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TPM4P67936 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TPM4P67936 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
TPM4P67936 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC24.08■■□□□ 1.44
TPM4P67936 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
TPM4P67936 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
TPM4P67936 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
TPM4P67936 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TPM4P67936 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TPM4P67936 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TPM4P67936 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TPM4P67936 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TPM4P67936 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TPM4P67936 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TPM4P67936 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TPM4P67936 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TPM4P67936 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
TPM4P67936 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TPM4P67936 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TPM4P67936 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TPM4P67936 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TPM4P67936 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TPM4P67936 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TPM4P67936 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TPM4P67936 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TPM4P67936 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TPM4P67936 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TPM4P67936 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms