Protein–RNA interactions for Protein: P62987

UBA52, Ubiquitin-60S ribosomal protein L40, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 128 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBA52P62987 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
UBA52P62987 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
UBA52P62987 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
UBA52P62987 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
UBA52P62987 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
UBA52P62987 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
UBA52P62987 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
UBA52P62987 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
UBA52P62987 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
UBA52P62987 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
UBA52P62987 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
UBA52P62987 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
UBA52P62987 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
UBA52P62987 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
UBA52P62987 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
UBA52P62987 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
UBA52P62987 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
UBA52P62987 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
UBA52P62987 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
UBA52P62987 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
UBA52P62987 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
UBA52P62987 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
UBA52P62987 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
UBA52P62987 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
UBA52P62987 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
UBA52P62987 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
UBA52P62987 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
UBA52P62987 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
UBA52P62987 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
UBA52P62987 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
UBA52P62987 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
UBA52P62987 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
UBA52P62987 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
UBA52P62987 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
UBA52P62987 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
UBA52P62987 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
UBA52P62987 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
UBA52P62987 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
UBA52P62987 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
UBA52P62987 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
UBA52P62987 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
UBA52P62987 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
UBA52P62987 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
UBA52P62987 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
UBA52P62987 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
UBA52P62987 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
UBA52P62987 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC18.46■□□□□ 0.55
UBA52P62987 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
UBA52P62987 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
UBA52P62987 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
UBA52P62987 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
UBA52P62987 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
UBA52P62987 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
UBA52P62987 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
UBA52P62987 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
UBA52P62987 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
UBA52P62987 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
UBA52P62987 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
UBA52P62987 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
UBA52P62987 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
UBA52P62987 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
UBA52P62987 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
UBA52P62987 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
UBA52P62987 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
UBA52P62987 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
UBA52P62987 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
UBA52P62987 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
UBA52P62987 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
UBA52P62987 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
UBA52P62987 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
UBA52P62987 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
UBA52P62987 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
UBA52P62987 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
UBA52P62987 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
UBA52P62987 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
UBA52P62987 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
UBA52P62987 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
UBA52P62987 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
UBA52P62987 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
UBA52P62987 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
UBA52P62987 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
UBA52P62987 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
UBA52P62987 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
UBA52P62987 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
UBA52P62987 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
UBA52P62987 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
UBA52P62987 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
UBA52P62987 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
UBA52P62987 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
UBA52P62987 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
UBA52P62987 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
UBA52P62987 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
UBA52P62987 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
UBA52P62987 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
UBA52P62987 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
UBA52P62987 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
UBA52P62987 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
UBA52P62987 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
UBA52P62987 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
UBA52P62987 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms