Protein–RNA interactions for Protein: P62314

SNRPD1, Small nuclear ribonucleoprotein Sm D1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 119 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNRPD1P62314 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SNRPD1P62314 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SNRPD1P62314 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
SNRPD1P62314 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SNRPD1P62314 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SNRPD1P62314 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SNRPD1P62314 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
SNRPD1P62314 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
SNRPD1P62314 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
SNRPD1P62314 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
SNRPD1P62314 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
SNRPD1P62314 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
SNRPD1P62314 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SNRPD1P62314 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
SNRPD1P62314 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SNRPD1P62314 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
SNRPD1P62314 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SNRPD1P62314 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SNRPD1P62314 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SNRPD1P62314 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SNRPD1P62314 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SNRPD1P62314 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SNRPD1P62314 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SNRPD1P62314 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SNRPD1P62314 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SNRPD1P62314 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SNRPD1P62314 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SNRPD1P62314 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SNRPD1P62314 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SNRPD1P62314 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SNRPD1P62314 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SNRPD1P62314 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
SNRPD1P62314 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
SNRPD1P62314 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SNRPD1P62314 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SNRPD1P62314 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SNRPD1P62314 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SNRPD1P62314 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SNRPD1P62314 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SNRPD1P62314 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SNRPD1P62314 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
SNRPD1P62314 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SNRPD1P62314 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SNRPD1P62314 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SNRPD1P62314 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SNRPD1P62314 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SNRPD1P62314 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SNRPD1P62314 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SNRPD1P62314 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SNRPD1P62314 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SNRPD1P62314 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SNRPD1P62314 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SNRPD1P62314 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SNRPD1P62314 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SNRPD1P62314 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SNRPD1P62314 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SNRPD1P62314 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
SNRPD1P62314 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SNRPD1P62314 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SNRPD1P62314 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SNRPD1P62314 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SNRPD1P62314 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SNRPD1P62314 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SNRPD1P62314 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SNRPD1P62314 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SNRPD1P62314 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SNRPD1P62314 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SNRPD1P62314 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SNRPD1P62314 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SNRPD1P62314 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SNRPD1P62314 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SNRPD1P62314 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SNRPD1P62314 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SNRPD1P62314 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SNRPD1P62314 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SNRPD1P62314 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SNRPD1P62314 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SNRPD1P62314 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SNRPD1P62314 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SNRPD1P62314 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SNRPD1P62314 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SNRPD1P62314 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SNRPD1P62314 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SNRPD1P62314 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SNRPD1P62314 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SNRPD1P62314 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SNRPD1P62314 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SNRPD1P62314 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SNRPD1P62314 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SNRPD1P62314 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SNRPD1P62314 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SNRPD1P62314 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SNRPD1P62314 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SNRPD1P62314 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SNRPD1P62314 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SNRPD1P62314 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SNRPD1P62314 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SNRPD1P62314 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SNRPD1P62314 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SNRPD1P62314 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.4 ms