Protein–RNA interactions for Protein: P60608

ERVFC1-1, Endogenous retrovirus group FC1 member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 527 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVFC1-1P60608 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ERVFC1-1P60608 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ERVFC1-1P60608 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ERVFC1-1P60608 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ERVFC1-1P60608 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ERVFC1-1P60608 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ERVFC1-1P60608 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ERVFC1-1P60608 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ERVFC1-1P60608 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ERVFC1-1P60608 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ERVFC1-1P60608 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ERVFC1-1P60608 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ERVFC1-1P60608 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ERVFC1-1P60608 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
ERVFC1-1P60608 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ERVFC1-1P60608 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ERVFC1-1P60608 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ERVFC1-1P60608 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ERVFC1-1P60608 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
ERVFC1-1P60608 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ERVFC1-1P60608 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ERVFC1-1P60608 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ERVFC1-1P60608 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ERVFC1-1P60608 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ERVFC1-1P60608 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ERVFC1-1P60608 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ERVFC1-1P60608 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ERVFC1-1P60608 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ERVFC1-1P60608 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ERVFC1-1P60608 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ERVFC1-1P60608 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ERVFC1-1P60608 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ERVFC1-1P60608 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ERVFC1-1P60608 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
ERVFC1-1P60608 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ERVFC1-1P60608 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ERVFC1-1P60608 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ERVFC1-1P60608 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ERVFC1-1P60608 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ERVFC1-1P60608 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ERVFC1-1P60608 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ERVFC1-1P60608 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
ERVFC1-1P60608 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ERVFC1-1P60608 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ERVFC1-1P60608 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ERVFC1-1P60608 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ERVFC1-1P60608 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ERVFC1-1P60608 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ERVFC1-1P60608 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ERVFC1-1P60608 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ERVFC1-1P60608 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ERVFC1-1P60608 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ERVFC1-1P60608 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
ERVFC1-1P60608 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ERVFC1-1P60608 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
ERVFC1-1P60608 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ERVFC1-1P60608 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ERVFC1-1P60608 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
ERVFC1-1P60608 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
ERVFC1-1P60608 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
ERVFC1-1P60608 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ERVFC1-1P60608 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ERVFC1-1P60608 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
ERVFC1-1P60608 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
ERVFC1-1P60608 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ERVFC1-1P60608 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
ERVFC1-1P60608 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
ERVFC1-1P60608 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.26
ERVFC1-1P60608 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ERVFC1-1P60608 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ERVFC1-1P60608 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ERVFC1-1P60608 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ERVFC1-1P60608 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ERVFC1-1P60608 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ERVFC1-1P60608 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ERVFC1-1P60608 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ERVFC1-1P60608 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
ERVFC1-1P60608 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ERVFC1-1P60608 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ERVFC1-1P60608 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ERVFC1-1P60608 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ERVFC1-1P60608 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ERVFC1-1P60608 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ERVFC1-1P60608 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ERVFC1-1P60608 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ERVFC1-1P60608 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ERVFC1-1P60608 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ERVFC1-1P60608 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ERVFC1-1P60608 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ERVFC1-1P60608 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ERVFC1-1P60608 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ERVFC1-1P60608 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ERVFC1-1P60608 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ERVFC1-1P60608 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ERVFC1-1P60608 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ERVFC1-1P60608 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ERVFC1-1P60608 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
ERVFC1-1P60608 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ERVFC1-1P60608 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ERVFC1-1P60608 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms