Protein–RNA interactions for Protein: P58872

RHBDL3, Rhomboid-related protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHBDL3P58872 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
RHBDL3P58872 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
RHBDL3P58872 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
RHBDL3P58872 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
RHBDL3P58872 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC25.75■■□□□ 1.71
RHBDL3P58872 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
RHBDL3P58872 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
RHBDL3P58872 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
RHBDL3P58872 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
RHBDL3P58872 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
RHBDL3P58872 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
RHBDL3P58872 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
RHBDL3P58872 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
RHBDL3P58872 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
RHBDL3P58872 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
RHBDL3P58872 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
RHBDL3P58872 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
RHBDL3P58872 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
RHBDL3P58872 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
RHBDL3P58872 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
RHBDL3P58872 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
RHBDL3P58872 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
RHBDL3P58872 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
RHBDL3P58872 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
RHBDL3P58872 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
RHBDL3P58872 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
RHBDL3P58872 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
RHBDL3P58872 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
RHBDL3P58872 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
RHBDL3P58872 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
RHBDL3P58872 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
RHBDL3P58872 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
RHBDL3P58872 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
RHBDL3P58872 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
RHBDL3P58872 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
RHBDL3P58872 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
RHBDL3P58872 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
RHBDL3P58872 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
RHBDL3P58872 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
RHBDL3P58872 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
RHBDL3P58872 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
RHBDL3P58872 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
RHBDL3P58872 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
RHBDL3P58872 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
RHBDL3P58872 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
RHBDL3P58872 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
RHBDL3P58872 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
RHBDL3P58872 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
RHBDL3P58872 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
RHBDL3P58872 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
RHBDL3P58872 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
RHBDL3P58872 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
RHBDL3P58872 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
RHBDL3P58872 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
RHBDL3P58872 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
RHBDL3P58872 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
RHBDL3P58872 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
RHBDL3P58872 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
RHBDL3P58872 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
RHBDL3P58872 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
RHBDL3P58872 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
RHBDL3P58872 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
RHBDL3P58872 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
RHBDL3P58872 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
RHBDL3P58872 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
RHBDL3P58872 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
RHBDL3P58872 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
RHBDL3P58872 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
RHBDL3P58872 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
RHBDL3P58872 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
RHBDL3P58872 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
RHBDL3P58872 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
RHBDL3P58872 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC25.7■■□□□ 1.7
RHBDL3P58872 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
RHBDL3P58872 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
RHBDL3P58872 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
RHBDL3P58872 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
RHBDL3P58872 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
RHBDL3P58872 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
RHBDL3P58872 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
RHBDL3P58872 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
RHBDL3P58872 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
RHBDL3P58872 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
RHBDL3P58872 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC25.69■■□□□ 1.7
RHBDL3P58872 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
RHBDL3P58872 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
RHBDL3P58872 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
RHBDL3P58872 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
RHBDL3P58872 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
RHBDL3P58872 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
RHBDL3P58872 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
RHBDL3P58872 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
RHBDL3P58872 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
RHBDL3P58872 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
RHBDL3P58872 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
RHBDL3P58872 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
RHBDL3P58872 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
RHBDL3P58872 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
RHBDL3P58872 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
RHBDL3P58872 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms