Protein–RNA interactions for Protein: P58215

LOXL3, Lysyl oxidase homolog 3, humanhuman

Predictions only

Length 753 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LOXL3P58215 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
LOXL3P58215 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
LOXL3P58215 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
LOXL3P58215 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
LOXL3P58215 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
LOXL3P58215 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
LOXL3P58215 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
LOXL3P58215 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
LOXL3P58215 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
LOXL3P58215 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
LOXL3P58215 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
LOXL3P58215 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
LOXL3P58215 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
LOXL3P58215 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
LOXL3P58215 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
LOXL3P58215 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
LOXL3P58215 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
LOXL3P58215 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
LOXL3P58215 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
LOXL3P58215 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
LOXL3P58215 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
LOXL3P58215 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
LOXL3P58215 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
LOXL3P58215 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
LOXL3P58215 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
LOXL3P58215 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
LOXL3P58215 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
LOXL3P58215 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
LOXL3P58215 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
LOXL3P58215 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
LOXL3P58215 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
LOXL3P58215 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
LOXL3P58215 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
LOXL3P58215 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
LOXL3P58215 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
LOXL3P58215 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
LOXL3P58215 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
LOXL3P58215 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
LOXL3P58215 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
LOXL3P58215 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
LOXL3P58215 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
LOXL3P58215 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
LOXL3P58215 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
LOXL3P58215 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
LOXL3P58215 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
LOXL3P58215 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
LOXL3P58215 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
LOXL3P58215 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
LOXL3P58215 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
LOXL3P58215 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
LOXL3P58215 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
LOXL3P58215 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
LOXL3P58215 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
LOXL3P58215 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
LOXL3P58215 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
LOXL3P58215 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
LOXL3P58215 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
LOXL3P58215 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
LOXL3P58215 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
LOXL3P58215 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
LOXL3P58215 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
LOXL3P58215 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
LOXL3P58215 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
LOXL3P58215 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
LOXL3P58215 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
LOXL3P58215 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
LOXL3P58215 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
LOXL3P58215 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
LOXL3P58215 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
LOXL3P58215 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
LOXL3P58215 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
LOXL3P58215 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
LOXL3P58215 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
LOXL3P58215 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
LOXL3P58215 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
LOXL3P58215 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
LOXL3P58215 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
LOXL3P58215 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
LOXL3P58215 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
LOXL3P58215 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
LOXL3P58215 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
LOXL3P58215 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
LOXL3P58215 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
LOXL3P58215 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
LOXL3P58215 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
LOXL3P58215 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
LOXL3P58215 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
LOXL3P58215 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
LOXL3P58215 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
LOXL3P58215 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
LOXL3P58215 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
LOXL3P58215 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
LOXL3P58215 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
LOXL3P58215 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
LOXL3P58215 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
LOXL3P58215 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
LOXL3P58215 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
LOXL3P58215 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
LOXL3P58215 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
LOXL3P58215 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36 ms