Protein–RNA interactions for Protein: P55058

PLTP, Phospholipid transfer protein, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLTPP55058 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PLTPP55058 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PLTPP55058 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PLTPP55058 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PLTPP55058 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PLTPP55058 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
PLTPP55058 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
PLTPP55058 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PLTPP55058 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PLTPP55058 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
PLTPP55058 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.15
PLTPP55058 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PLTPP55058 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PLTPP55058 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PLTPP55058 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PLTPP55058 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PLTPP55058 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PLTPP55058 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PLTPP55058 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PLTPP55058 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PLTPP55058 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PLTPP55058 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PLTPP55058 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PLTPP55058 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PLTPP55058 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
PLTPP55058 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PLTPP55058 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PLTPP55058 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PLTPP55058 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PLTPP55058 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
PLTPP55058 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PLTPP55058 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PLTPP55058 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PLTPP55058 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PLTPP55058 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PLTPP55058 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PLTPP55058 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PLTPP55058 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
PLTPP55058 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PLTPP55058 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PLTPP55058 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PLTPP55058 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PLTPP55058 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PLTPP55058 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PLTPP55058 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PLTPP55058 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PLTPP55058 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PLTPP55058 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PLTPP55058 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PLTPP55058 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PLTPP55058 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PLTPP55058 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PLTPP55058 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PLTPP55058 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PLTPP55058 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PLTPP55058 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PLTPP55058 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PLTPP55058 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PLTPP55058 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PLTPP55058 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PLTPP55058 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PLTPP55058 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PLTPP55058 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PLTPP55058 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PLTPP55058 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PLTPP55058 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PLTPP55058 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PLTPP55058 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PLTPP55058 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PLTPP55058 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PLTPP55058 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PLTPP55058 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PLTPP55058 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PLTPP55058 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PLTPP55058 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PLTPP55058 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PLTPP55058 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PLTPP55058 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PLTPP55058 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PLTPP55058 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PLTPP55058 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PLTPP55058 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PLTPP55058 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PLTPP55058 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PLTPP55058 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PLTPP55058 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PLTPP55058 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PLTPP55058 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PLTPP55058 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PLTPP55058 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
PLTPP55058 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PLTPP55058 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PLTPP55058 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PLTPP55058 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PLTPP55058 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PLTPP55058 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PLTPP55058 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
PLTPP55058 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PLTPP55058 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PLTPP55058 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.8 ms