Protein–RNA interactions for Protein: P54577

YARS, Tyrosine--tRNA ligase, cytoplasmic, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 528 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
YARSP54577 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
YARSP54577 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
YARSP54577 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
YARSP54577 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC23.52■■□□□ 1.36
YARSP54577 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
YARSP54577 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
YARSP54577 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
YARSP54577 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
YARSP54577 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
YARSP54577 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
YARSP54577 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
YARSP54577 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
YARSP54577 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
YARSP54577 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
YARSP54577 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
YARSP54577 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
YARSP54577 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
YARSP54577 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
YARSP54577 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
YARSP54577 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
YARSP54577 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
YARSP54577 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
YARSP54577 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
YARSP54577 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
YARSP54577 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
YARSP54577 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
YARSP54577 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
YARSP54577 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
YARSP54577 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC23.5■■□□□ 1.35
YARSP54577 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
YARSP54577 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
YARSP54577 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
YARSP54577 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
YARSP54577 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
YARSP54577 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
YARSP54577 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
YARSP54577 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
YARSP54577 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
YARSP54577 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
YARSP54577 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
YARSP54577 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
YARSP54577 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
YARSP54577 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
YARSP54577 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
YARSP54577 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
YARSP54577 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
YARSP54577 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
YARSP54577 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
YARSP54577 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
YARSP54577 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
YARSP54577 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
YARSP54577 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
YARSP54577 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
YARSP54577 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
YARSP54577 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
YARSP54577 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
YARSP54577 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
YARSP54577 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
YARSP54577 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
YARSP54577 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
YARSP54577 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
YARSP54577 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
YARSP54577 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
YARSP54577 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
YARSP54577 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
YARSP54577 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
YARSP54577 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
YARSP54577 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
YARSP54577 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
YARSP54577 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
YARSP54577 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
YARSP54577 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
YARSP54577 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
YARSP54577 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
YARSP54577 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
YARSP54577 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
YARSP54577 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
YARSP54577 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
YARSP54577 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
YARSP54577 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
YARSP54577 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
YARSP54577 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
YARSP54577 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
YARSP54577 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
YARSP54577 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
YARSP54577 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
YARSP54577 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
YARSP54577 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
YARSP54577 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
YARSP54577 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
YARSP54577 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
YARSP54577 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
YARSP54577 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
YARSP54577 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
YARSP54577 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
YARSP54577 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
YARSP54577 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
YARSP54577 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
YARSP54577 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
YARSP54577 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms