Protein–RNA interactions for Protein: P53803

POLR2K, DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 58 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2KP53803 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
POLR2KP53803 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
POLR2KP53803 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
POLR2KP53803 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
POLR2KP53803 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
POLR2KP53803 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
POLR2KP53803 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
POLR2KP53803 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
POLR2KP53803 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
POLR2KP53803 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
POLR2KP53803 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
POLR2KP53803 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
POLR2KP53803 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
POLR2KP53803 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
POLR2KP53803 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
POLR2KP53803 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
POLR2KP53803 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
POLR2KP53803 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
POLR2KP53803 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
POLR2KP53803 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
POLR2KP53803 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
POLR2KP53803 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
POLR2KP53803 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
POLR2KP53803 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
POLR2KP53803 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
POLR2KP53803 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
POLR2KP53803 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
POLR2KP53803 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
POLR2KP53803 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
POLR2KP53803 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
POLR2KP53803 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
POLR2KP53803 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
POLR2KP53803 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
POLR2KP53803 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
POLR2KP53803 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
POLR2KP53803 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
POLR2KP53803 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
POLR2KP53803 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
POLR2KP53803 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
POLR2KP53803 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
POLR2KP53803 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
POLR2KP53803 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
POLR2KP53803 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
POLR2KP53803 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
POLR2KP53803 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
POLR2KP53803 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
POLR2KP53803 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
POLR2KP53803 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
POLR2KP53803 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
POLR2KP53803 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
POLR2KP53803 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
POLR2KP53803 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC15.28■□□□□ 0.04
POLR2KP53803 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC15.28■□□□□ 0.04
POLR2KP53803 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
POLR2KP53803 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
POLR2KP53803 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
POLR2KP53803 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
POLR2KP53803 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
POLR2KP53803 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
POLR2KP53803 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
POLR2KP53803 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
POLR2KP53803 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
POLR2KP53803 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
POLR2KP53803 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
POLR2KP53803 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
POLR2KP53803 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
POLR2KP53803 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
POLR2KP53803 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
POLR2KP53803 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
POLR2KP53803 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
POLR2KP53803 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
POLR2KP53803 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
POLR2KP53803 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
POLR2KP53803 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
POLR2KP53803 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
POLR2KP53803 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
POLR2KP53803 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
POLR2KP53803 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
POLR2KP53803 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
POLR2KP53803 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
POLR2KP53803 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
POLR2KP53803 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
POLR2KP53803 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
POLR2KP53803 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
POLR2KP53803 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
POLR2KP53803 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
POLR2KP53803 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
POLR2KP53803 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
POLR2KP53803 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
POLR2KP53803 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
POLR2KP53803 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
POLR2KP53803 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
POLR2KP53803 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
POLR2KP53803 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
POLR2KP53803 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
POLR2KP53803 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
POLR2KP53803 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
POLR2KP53803 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
POLR2KP53803 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
POLR2KP53803 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms