Protein–RNA interactions for Protein: P52797

EFNA3, Ephrin-A3, humanhuman

Predictions only

Length 238 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFNA3P52797 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
EFNA3P52797 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
EFNA3P52797 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
EFNA3P52797 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
EFNA3P52797 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
EFNA3P52797 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
EFNA3P52797 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
EFNA3P52797 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
EFNA3P52797 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
EFNA3P52797 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
EFNA3P52797 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
EFNA3P52797 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
EFNA3P52797 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
EFNA3P52797 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
EFNA3P52797 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
EFNA3P52797 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
EFNA3P52797 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
EFNA3P52797 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
EFNA3P52797 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
EFNA3P52797 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
EFNA3P52797 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
EFNA3P52797 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
EFNA3P52797 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC20.27■□□□□ 0.84
EFNA3P52797 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
EFNA3P52797 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
EFNA3P52797 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
EFNA3P52797 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
EFNA3P52797 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
EFNA3P52797 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
EFNA3P52797 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
EFNA3P52797 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
EFNA3P52797 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
EFNA3P52797 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
EFNA3P52797 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
EFNA3P52797 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
EFNA3P52797 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
EFNA3P52797 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
EFNA3P52797 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
EFNA3P52797 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
EFNA3P52797 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
EFNA3P52797 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
EFNA3P52797 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
EFNA3P52797 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
EFNA3P52797 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
EFNA3P52797 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
EFNA3P52797 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
EFNA3P52797 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
EFNA3P52797 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
EFNA3P52797 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
EFNA3P52797 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
EFNA3P52797 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
EFNA3P52797 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
EFNA3P52797 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
EFNA3P52797 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
EFNA3P52797 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
EFNA3P52797 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
EFNA3P52797 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
EFNA3P52797 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
EFNA3P52797 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
EFNA3P52797 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
EFNA3P52797 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
EFNA3P52797 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
EFNA3P52797 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC20.24■□□□□ 0.83
EFNA3P52797 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
EFNA3P52797 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
EFNA3P52797 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
EFNA3P52797 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
EFNA3P52797 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
EFNA3P52797 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
EFNA3P52797 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
EFNA3P52797 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
EFNA3P52797 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
EFNA3P52797 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
EFNA3P52797 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
EFNA3P52797 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
EFNA3P52797 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
EFNA3P52797 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
EFNA3P52797 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
EFNA3P52797 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
EFNA3P52797 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
EFNA3P52797 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
EFNA3P52797 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
EFNA3P52797 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
EFNA3P52797 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
EFNA3P52797 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC20.23■□□□□ 0.83
EFNA3P52797 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
EFNA3P52797 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
EFNA3P52797 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
EFNA3P52797 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
EFNA3P52797 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
EFNA3P52797 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
EFNA3P52797 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
EFNA3P52797 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
EFNA3P52797 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
EFNA3P52797 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
EFNA3P52797 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
EFNA3P52797 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
EFNA3P52797 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
EFNA3P52797 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
EFNA3P52797 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms