Protein–RNA interactions for Protein: P51159

RAB27A, Ras-related protein Rab-27A, humanhuman

Predictions only

Length 221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB27AP51159 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
RAB27AP51159 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
RAB27AP51159 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RAB27AP51159 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.35
RAB27AP51159 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RAB27AP51159 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RAB27AP51159 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RAB27AP51159 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
RAB27AP51159 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
RAB27AP51159 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC23.51■■□□□ 1.35
RAB27AP51159 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
RAB27AP51159 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RAB27AP51159 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RAB27AP51159 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
RAB27AP51159 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
RAB27AP51159 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RAB27AP51159 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RAB27AP51159 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RAB27AP51159 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
RAB27AP51159 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
RAB27AP51159 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
RAB27AP51159 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RAB27AP51159 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
RAB27AP51159 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RAB27AP51159 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RAB27AP51159 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RAB27AP51159 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RAB27AP51159 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RAB27AP51159 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RAB27AP51159 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RAB27AP51159 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RAB27AP51159 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RAB27AP51159 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RAB27AP51159 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RAB27AP51159 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RAB27AP51159 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RAB27AP51159 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RAB27AP51159 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RAB27AP51159 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RAB27AP51159 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RAB27AP51159 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RAB27AP51159 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RAB27AP51159 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RAB27AP51159 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RAB27AP51159 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RAB27AP51159 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RAB27AP51159 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RAB27AP51159 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RAB27AP51159 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RAB27AP51159 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RAB27AP51159 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RAB27AP51159 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RAB27AP51159 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RAB27AP51159 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RAB27AP51159 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RAB27AP51159 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RAB27AP51159 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RAB27AP51159 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RAB27AP51159 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RAB27AP51159 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RAB27AP51159 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
RAB27AP51159 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RAB27AP51159 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RAB27AP51159 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RAB27AP51159 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RAB27AP51159 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RAB27AP51159 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RAB27AP51159 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RAB27AP51159 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
RAB27AP51159 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
RAB27AP51159 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
RAB27AP51159 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RAB27AP51159 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
RAB27AP51159 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
RAB27AP51159 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RAB27AP51159 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC23.46■■□□□ 1.35
RAB27AP51159 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
RAB27AP51159 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
RAB27AP51159 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RAB27AP51159 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RAB27AP51159 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RAB27AP51159 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RAB27AP51159 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RAB27AP51159 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
RAB27AP51159 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RAB27AP51159 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RAB27AP51159 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
RAB27AP51159 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RAB27AP51159 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RAB27AP51159 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RAB27AP51159 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
RAB27AP51159 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RAB27AP51159 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RAB27AP51159 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RAB27AP51159 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RAB27AP51159 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RAB27AP51159 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RAB27AP51159 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RAB27AP51159 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RAB27AP51159 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 275.6 ms